El Imperio Otomano mantuvo estrechas relaciones con las ciudades estado italianas vecinas en los siglos XVI y XVII. Yacub Pasha (1425-1481), médico personal de Mehmed II el Conquistador, fue un judío italiano que alcanzó el título de pachá y visir. Domenico Hierosolimitano (hacia 1552-1622), tercer médico del sultán Murad III, era un rabino jerosolimitano. Su libro es una fuente importante sobre la vida cotidiana y la práctica médica en Estambul en aquella época. Nuh bin Abd al-Mennab (1627-1707), también de origen italiano, fue el médico jefe del Imperio Otomano, que tradujo una farmacopea al turco. En el mismo siglo, dos italianos, Israel Conegliano (Conian) y Tobia Cohen, se convirtieron en médicos privados de los principales pashas otomanos y del Gran Visir. A. Vuccino (1829-1893) y Antoine Calleja Pasha (1806-1893) enseñaron en la Escuela de Medicina de Estambul. Italia fue un país privilegiado para la educación médica durante el primer periodo de occidentalización otomana. Sanizade Mehmet Ataullah Efendi (1771-1826) tradujo del italiano al turco el primer libro de medicina impreso en el Imperio Otomano. Mustafa Behcet Efendi (1774-1833), médico jefe del sultán y fundador de la primera escuela de medicina occidental en Turquía, tradujo varios libros de medicina del italiano al turco. La primera farmacopea impresa en el Imperio Otomano también fue originalmente italiana En el siglo XIX, Edouard Ottoni y su hijo Giuseppe Ottoni fueron conocidos farmacéuticos militares, ambos con el nombre de Faik Pasha. Probablemente el médico de origen italiano más influyente fue Giovanni Battista Violi (1849-1928), que ejerció la pediatría en Turquía durante más de cincuenta años. Violi fue el fundador del primer hospital infantil, el primer instituto de vacunas y la primera revista pediátrica del Imperio Otomano.