Díky pokroku v zobrazování, včetně kombinace morfologických a funkčních parametrů, se dále zlepšila diagnostická účinnost magnetické rezonance. Většina neurčitých hmot na USG a CT tak může být správně diagnostikována pomocí MRI . MRI je nejpřínosnější u žen s nízkou pravděpodobností výskytu rakoviny. Endometriomy, běžné mimikry karcinomu vaječníků na CT a US, vykazují specifické zobrazovací nálezy na MRI. To platí i pro subserózní leiomyomy, které je při USG často obtížné odlišit od solidních ovariálních útvarů. Pečlivá analýza anatomických orientačních bodů a vzorů posunu pomáhá při odlišení benigních extraovariálních nádorů, zejména extraperitoneálního původu, např. neurinomů, od karcinomu vaječníků. Odlišení některých komplexních cystických a solidních adnexálních útvarů od karcinomu ovaria může být náročné. U těchto lézí integrace klinických nálezů umožní ve většině případů odlišení benigních lézí od karcinomu. Torze vaječníku, pánevní hematom a extrauterinní těhotenství jsou obvykle spojeny s pánevní bolestí. Bolest a zánětlivé laboratorní nálezy svědčí pro tuberózní ovariální absces (TOA). TOA může imitovat ovariální karcinom i při pokročilém zobrazování, včetně MRI a PET/CT. Aspergilóza, podtyp TOA, napodobuje karcinom vaječníků díky své komplexní morfologii a invazivnímu způsobu růstu. Odlišení peritoneální tuberkulózy od pokročilého karcinomu vaječníků je obtížné a vyžaduje biopsii .

.