Fremskridt inden for billeddannelse, herunder kombinationen af morfologiske og funktionelle parametre, har yderligere forbedret MRI’s diagnostiske ydeevne. Således kan størstedelen af ubestemte masser på US og CT diagnosticeres korrekt med MRI . MRI er mest fordelagtig hos kvinder med en lav sandsynlighed for kræft. Endometriomer, som er almindelige efterligninger af æggestokkræft i CT og US, viser specifikke billeddannelsesresultater i MRI. Dette gælder også for subserøse leiomyomer, som ofte er vanskelige at skelne fra solide ovariehodemer i US. En omhyggelig analyse af anatomiske landemærker og forskydningsmønstre hjælper med at skelne benigne ekstraovariære tumorer, især af ekstraperitoneal oprindelse, f.eks. neurinomer, fra ovariecancer. Det kan være vanskeligt at skelne visse komplekse cystiske og solide adnex-masser fra ovariecancer. I disse læsioner vil det i de fleste tilfælde være muligt at skelne benigne læsioner fra cancer ved at integrere de kliniske fund. Ovarietorsion, bækkenhæmatomer og ekstrauterin graviditet er typisk forbundet med bækkensmerter. Smerter og inflammatoriske laboratoriefund tyder på tubo ovarieabscess (TOA). TOA kan efterligne ovariecancer, selv ved avanceret billeddannelse, herunder MRI og PET/CT. Aspergillose, en undertype af TOA, efterligner æggestokkræft på grund af dens komplekse morfologi og invasive vækstmønster. Differentiering af peritoneal tuberkulose fra fremskreden ovariecancer er vanskelig og kræver biopsi .