Måske var Diocletianus’ program for indenlandske reformer måske vigtigere for opretholdelsen af riget. Han var ikke en fuldstændig fornyer på dette område, for hans forgængere havde gjort nogle forsigtige forsøg i samme retning; kejser Gallienus havde udelukket senatorer fra hæren og adskilt militære og civile karrierer. Senatet var gradvist blevet frataget sine privilegier. Diokletian systematiserede imidlertid disse ordninger på en sådan måde, at alle hans reformer førte til en slags centraliseret og absolut monarki, der stillede effektive handlemuligheder til hans rådighed. Således udpegede Diokletian konsulerne; senatorerne samarbejdede ikke længere ved udarbejdelsen af love; de kejserlige rådgivere (consilia sacra) blev fordelt på specialiserede kontorer, og deres funktioner blev nøje defineret, således at prætorianerpræfekterne (kejserens personlige livvagter) fik begrænset deres magt; specialiseringen af det administrative arbejde voksede; og antallet af bureaukrater steg. Dette var begyndelsen til det bureaukrati og teknokrati, der med tiden skulle komme til at oversvømme de moderne samfund.
En sådan organisering gjorde det muligt for administrationen at stole mindre på det enkelte menneske og mere på anvendelsen af lovtekster. Det var faktisk under Diokletians regeringstid, at den gregorianske og den hermogeniske kodeks, som der kun er fragmenter tilbage af, blev omskrevet. Men 1.200 bevarede reskriptudgaver viser et andet aspekt af kejserens personlighed. Diokletian var konservativ og var optaget af at bevare de gamle dyder: børns forpligtelse til at forsørge deres forældre i alderdommen, forældres forpligtelse til at behandle deres børn retfærdigt, ægtefællers forpligtelse til at respektere ægteskabslovene, sønners forpligtelse til ikke at vidne mod deres fædre eller slaver mod deres herrer og beskyttelse af privat ejendom, kreditorrettigheder og kontraktklausuler. Han forbød brugen af tortur, hvis sandheden kunne opdages på anden vis, og opfordrede guvernørerne til at være så autonome som muligt.
Hæren blev også reorganiseret og bragt tilbage til den gamle disciplin. Sedentære tropper (lokale tropper) blev sendt til grænserne, og den beredne hær (den bevægelige hovedhær) blev gjort indenlandsk. Troppestyrken blev forøget med en fjerdedel (ikke ganget med fire, som Lactantius hævder). Også her var Diokletians reformer gennemsyret af en sans for de menneskelige realiteter; han fritog soldaterne for tjeneste efter 20 års tjeneste, og hvis han begrænsede prisen på varer for at reducere leveomkostningerne, var det hovedsagelig for at gøre livet lettere for tropperne. Hvis man skal tro Lactantius, opdelte Diokletian provinserne “for at gøre sig selv mere frygtet”, men i virkeligheden var det for at bringe guvernørerne tættere på dem, de administrerede, og ved at fragmentere deres magt mindske deres territoriale styrke ved at opsplitte deres magt. Han påtog sig at fremme den økonomiske udvikling gennem en genopretning af landbruget og et byggeprogram.
Disse politikker var dyre, ligesom krige og arven fra en ustabil finansiel situation var dyre. Diocletians finanspolitiske løsninger er stadig omdiskuteret; de udgør et meget vanskeligt problem. Der blev indført to nye skatter, jugum og capitatio, førstnævnte var en skat på en enhed dyrkbar jord, sidstnævnte en skat på enkeltpersoner. Skatterne blev opkrævet på et proportionelt grundlag, idet bidragets størrelse blev bestemt af produktiviteten og dyrkningsformen. Som regel var der tale om en slags socioøkonomisk beskatning baseret på sammenhængen mellem mennesker og jord i form af enten ejerskab eller produktivitet. Der blev foretaget vurderinger hvert femte år; senere blev systemet konsolideret til en cyklus på 15 år kaldet en indictio. Denne optælling af skattepligtige voksne gav anledning til voldsom kritik, men havde den teoretiske fordel, at den erstattede de vilkårlige afgifter fra den tidligere tid. Ganske vist var det finansielle system udsat for overskridelser; men Diokletians formål var at skaffe midler, og han skånede ikke engang Italien, som indtil da havde været fritaget for jordbeskatning.
Denne reform blev ledsaget af en monetær reform, herunder genindførelse af en sund guld- og sølvmønt med fast design, skabelse af en ny bronzemønt, cirkulation af små mønter for at lette den daglige finansielle udveksling, decentralisering af møntningen og en forøgelse af antallet af møntsteder fra 8 til 15.
Alle disse foranstaltninger havde en tendens til at afværge finanskriser. Det berømte Edictum de Maximis Pretiis blev udstedt i 301 ce, der fastlagde lønninger og fastsatte maksimumspriser for at forhindre inflation, misbrugte fortjenester og udnyttelse af købere. Der blev opregnet ca. 1.000 artikler, og overtrædelse heraf blev straffet med døden; der blev krævet strenge straffe for sorte handlende. Men selv på denne måde kunne denne regulering af priser og lønninger ikke håndhæves, og ediktet blev senere ophævet.