La aerolínea fue fundada como Comair Jet Express. Fue rebautizada en octubre de 2001 por la empresa matriz Delta Air Lines. Es propiedad al cien por cien de Delta Air Lines.
Delta Private Jets es un servicio de aviones privados, que está dirigido a empresas que necesitan servicio a destinos en un avión privado o que el aeropuerto no suministra de forma regular. Delta Private Jets también está disponible para los socios de SkyMiles Elite por un precio de compra de 300-800 dólares en determinadas rutas desde los centros de operaciones de Delta en Cincinnati, Atlanta y Nueva York. Además, este servicio permite a los viajeros evitar las molestias del vuelo, como la seguridad.
La sede de Delta Private Jets se encuentra en el edificio 82 Comair Boulevard, que solía ser la sede de Comair y se llamaba Comair General Office Building.
En junio de 2017, David Sneed, que había supervisado una serie de cambios, incluida la aceptación de SkyMiles como pago de las tarjetas de jet, dejó Delta Private Jets, donde era el ejecutivo principal. No se anunció inmediatamente ningún sustituto, aunque los responsables de Delta Air Lines dicen que siguen comprometidos con el servicio de jets privados. En julio de 2017, Delta Private Jets nombró al antiguo director de operaciones de Virgin Australia, Gary Hammes, como su nuevo presidente en sustitución de Sneed. En octubre de 2018, Gary Hammes fue sucedido por Jeff Mihalic, quien fue nombrado CEO de la compañía. Mihalic es el antiguo presidente de Delta Material Services. Al mismo tiempo, Lee Gossett, empleado de Delta desde hace mucho tiempo, fue nombrado Vicepresidente Senior de Operaciones y Director de Operaciones. Antes de su nombramiento, Gossett era el vicepresidente de mantenimiento de línea en Delta Air Lines.
En enero de 2017, Delta Private Jets anunció Sky Access, un nuevo programa de afiliación. Por una cuota de iniciación de 8.500 dólares y una renovación de 6.000 dólares, los miembros pueden reservar todos los vuelos de tramo vacío que deseen de forma gratuita. Los miembros obtienen la aeronave completa. DPJ dijo que voló más de 6.300 tramos vacíos en 2017.
En noviembre de 2018, DPJ anunció la expansión de sus capacidades de mantenimiento, reparación y revisión (MRO) mediante la apertura de una nueva ubicación en Sheltair Aviation en los terrenos del Aeropuerto Internacional de Ft. Lauderdale-Hollywood (FLL) en Florida.
El 9 de diciembre de 2019, Delta Air Lines anunció que tomó una participación en Wheels Up, un operador de vuelos chárter estadounidense fundado en 2013 y que opera 120 aviones (turbohélices gemelos King Air 350i, Citation Excels/XLSs, Citation Xs y jets de negocios Hawker 400XP) para sus 7.700 socios, para convertirse en su mayor inversor y fusionarlo en el primer trimestre de 2020 con su filial Delta Private Jets, para operar una flota de 190 aviones de negocios.