L’analyse du métabolome avec une couverture de tous les composants éventuellement détectables dans l’échantillon, plutôt que l’analyse de chaque métabolite individuel à un moment donné, peut être accomplie par l’analyse métabolique. Des approches ciblées et/ou non ciblées sont appliquées en fonction des besoins pour des expériences particulières. Le suivi de centaines de métabolites ou plus à un moment donné nécessite des techniques haut débit et haut de gamme qui permettent de cribler les changements relatifs, plutôt que les concentrations absolues, des composés dans une large gamme dynamique. La plupart des techniques analytiques utiles à ces fins utilisent des modules de séparation GC ou HPLC/UPLC couplés à un spectromètre de masse rapide et précis. Les séparations GC nécessitent une modification chimique (dérivatisation) avant l’analyse, et fonctionnent efficacement pour les petites molécules. Les séparations HPLC sont mieux adaptées à l’analyse des composés polaires et non polaires labiles et non volatils sous leur forme native. La perfusion directe et les techniques basées sur la RMN sont principalement utilisées pour l’empreinte digitale et le phénotypage instantané, le cas échéant. La découverte et la validation de biomarqueurs métaboliques sont des possibilités passionnantes et prometteuses offertes par l’analyse métabolique appliquée aux expériences biologiques et biomédicales. Nous avons démontré que les techniques GC-TOF-MS, HPLC/UPLC-RP-MS et HILIC-LC-MS utilisées pour l’analyse métabolique offrent une cartographie suffisante du métabolome fournissant aux chercheurs des données sûres pour l’analyse multivariée ultérieure et l’exploration de données.