A birodalom fenntartása szempontjából talán még fontosabb volt Diocletianus belpolitikai reformprogramja. Nem volt teljes újító ezen a téren, hiszen elődei már tettek néhány óvatos kísérletet ugyanebben az irányban; Gallienus császár kizárta a szenátorokat a hadseregből, és szétválasztotta a katonai és a polgári pályát. A szenátust fokozatosan megfosztották kiváltságaitól. Diocletianus azonban úgy rendszerezte ezeket az intézkedéseket, hogy minden reformja egyfajta központosított és abszolút monarchia felé vezetett, amely hatékony eszközöket bocsátott a rendelkezésére. Így Diocletianus kijelölte a konzulokat; a szenátorok többé nem működtek közre a törvényhozásban; a császári tanácsosokat (consilia sacra) szétosztották a szakosodott hivatalok között, és feladataikat szigorúan meghatározták, így a praetorianus prefektusok (a császár személyes testőrei) hatalmát korlátozták; a közigazgatási munka szakosodása nőtt; és a bürokraták száma is megnőtt. Ez volt a kezdete annak a bürokráciának és technokráciának, amely végül elárasztotta a modern társadalmakat.

Ez a szervezettség lehetővé tette, hogy a közigazgatás kevésbé támaszkodjon az egyes emberekre, és inkább a jogi szövegek alkalmazására. Valójában Diocletianus uralkodása alatt írták újra a gregorián és a hermogén törvénykönyveket, amelyekből csak töredékek maradtak fenn. Az 1200 fennmaradt átirat azonban a császár személyiségének egy másik aspektusát is megmutatja. A konzervatív Diocletianus az ősi erények megőrzésével foglalkozott: a gyermekek kötelessége, hogy öregkorukban is táplálják szüleiket; a szülőké, hogy igazságosan bánjanak gyermekeikkel; a házastársaké, hogy tartsák tiszteletben a házassági törvényeket; a fiúké, hogy ne tanúskodjanak apjuk ellen, vagy a rabszolgáké gazdájuk ellen; valamint a magántulajdon, a hitelezői jogok és a szerződési kikötések védelme. Megtiltotta a kínzás alkalmazását, ha az igazság másképp is kideríthető, és a kormányzókat a lehető legnagyobb önállóságra ösztönözte.

A hadsereget is átszervezték, és visszavezették a régi fegyelemhez. A szedentáris csapatokat (helyi csapatok) a határokhoz küldték, a készenléti hadsereget (fő mozgó hadsereg) pedig belföldivé tették. A csapatok létszámát negyedével növelték (nem négyszeresére, ahogy Lactantius állítja). Diocletianus reformjait itt is áthatotta az emberi realitások érzékelése; 20 év szolgálat után felmentette a katonákat a szolgálat alól, és ha korlátozta is az árucikkek árát, hogy csökkentse a megélhetési költségeket, ez elsősorban a katonák életének megkönnyítését szolgálta. Ha hinni lehet Lactantiusnak, Diocletianus azért osztotta fel a tartományokat, “hogy rettegettebbé tegye magát”, de valójában az volt a célja, hogy a helytartókat közelebb hozza azokhoz, akiket igazgattak, és hatalmuk feldarabolásával csökkentse területi erejüket. Vállalta, hogy a mezőgazdaság fellendítésével és egy építési programmal elősegíti a gazdasági fejlődést.

Az ilyen politika költséges volt, akárcsak a háborúk és a bizonytalan pénzügyi helyzet öröksége. Diocletianus fiskális megoldásait máig vitatják; nagyon nehéz problémát jelentenek. Két új adót vezettek be, a jugumot és a capitatio-t. Az előbbi a megművelhető földterület egységére kivetett adó, az utóbbi a magánszemélyekre kivetett adó volt. Az adókat arányos alapon vetették ki, a járulék összegét a termelékenység és a művelés típusa határozta meg. Rendszerint egyfajta társadalmi-gazdasági adózásról volt szó, amely az ember és a föld közötti tulajdonjogi vagy termelékenységi kapcsolaton alapult. Az értékbecslést ötévente végezték; később a rendszert egy 15 éves ciklusban, az úgynevezett indictio-ban foglalták össze. Az adóköteles felnőttek eme összeírása heves kritikákat váltott ki, de elméleti előnye volt, hogy felváltotta a korábbi korszak önkényes adóztatását. Az biztos, hogy a pénzügyi rendszerben voltak túlkapások; de Diocletianus célja a pénzszerzés volt, és még Itáliát sem kímélte, amely addig mentes volt a földadóztatástól.

Ezt a reformot pénzreform kísérte, amely magában foglalta a szilárd, rögzített mintájú arany- és ezüstpénzek visszaállítását, egy új bronzpénz létrehozását, a napi pénzváltást megkönnyítő kis érmék forgalomba hozatalát, a pénzverés decentralizálását és a pénzverdék számának 8-ról 15-re való növelését.

Mindezek az intézkedések a pénzügyi válságok elhárítására irányultak. A híres Edictum de Maximis Pretiis-t i. sz. 301-ben adták ki, amely rögzítette a béreket és megállapította a maximális árakat, hogy megakadályozza az inflációt, a visszaélésszerű nyereséget és a vevők kizsákmányolását. Mintegy 1000 árucikket soroltak fel, és megsértésükért halálbüntetés járt; a feketekereskedőkre súlyos büntetéseket szabtak ki. De még így sem volt végrehajtható ez az ár- és bérszabályozás, és az ediktumot később visszavonták.