Minamata, város, Kumamoto ken (prefektúra), délkeleti Kyushu, Japán. A Yatsushiro-öböl déli vége közelében fekszik.

A Nippon Chisso Hiryo Company vállalati városa, fő termékei a vegyi műtrágya, a karbid és a vinil-klorid. Minamata hagyományosan halászkikötő volt, és rendszeres tengeri összeköttetéssel rendelkezik Amakusa szigetével, az Amakusa-szigetcsoport fő szigetével. A környéken forró források találhatók.

1956 után a helyi halászok és családjaik körében felismertek egy néha halálos kimenetelű betegséget, amely “Minamata-kór” néven vált ismertté. Az okot a helyi vegyi üzemek által a tengerbe bocsátott hulladékokban lévő szerves higanyvegyületben találták meg. Ez a vegyület koncentrálódott a halakban és kagylókban, amelyeket aztán a helyi lakosok fogyasztottak. A betegség áldozatai higanymérgezést szenvednek, ami szellemi visszamaradottságot, súlyos születési rendellenességeket, látás- és halláskárosodást, bénulást és halált okozhat. A Minamata-kór, az első olyan betegség, amelynek okát a tengervíz ipari szennyezésében ismerték fel, világszerte aggodalmat keltett, és nagyban hozzájárult a környezetvédelmi mozgalom fejlődéséhez. A Minamata-öböl 1997 júliusától higanymentesnek minősült. Azokat a hálókat, amelyek megakadályozták, hogy a halak a környező vizekbe ússzanak, eltávolították. Népesség. (2005) 29,119; (2010) 26,978.