A Washington Adventista Egyetemet 1904-ben alapították koedukált intézményként, Washington Training College néven. Célja az volt, hogy fiatal férfiakat és nőket képezzen a szabad művészetek terén. Amikor 1907-ben a nevet Washington Foreign Mission Seminaryre változtatták, a misszionáriusok speciális képzésének szűkebb célja felváltotta a szabad művészeti főiskola eredeti koncepcióját. 1914-ben a főiskola visszanyerte a szabad művészeti főiskola státuszát, és felvette a Washington Missionary College nevet. Az 1915. május 22-én tartott első diplomaosztón öt hallgató kapta meg a bachelor of arts fokozatot. A folyamatos növekedés és fejlődés további változásokhoz vezetett. 1933-ban az alsó tagozatot Columbia Junior College néven szervezték meg, és akkreditációt kapott. Különálló főiskolaként 1942-ben szűnt meg, amikor a Washington Missionary College négyéves, diplomát adó intézményként akkreditációt kapott a Middle States Association of Colleges and Secondary Schools-tól. 1961 márciusában a főiskola választmánya megszavazta, hogy a főiskola nevét Columbia Union College-ra változtassák. 2009-ben a Columbia Union College elnyerte az egyetemi státuszt, és a főiskola választmánya megszavazta, hogy a főiskola neve Washington Adventista Egyetemre változzon.