L’analisi del metaboloma con la copertura di tutti i componenti eventualmente rilevabili nel campione, piuttosto che l’analisi di ogni singolo metabolita in un dato momento, può essere realizzata dall’analisi metabolica. Approcci mirati e/o non mirati sono applicati secondo le necessità di particolari esperimenti. Il monitoraggio di centinaia o più metaboliti in un dato momento richiede tecniche high-throughput e high-end che permettono lo screening dei cambiamenti relativi, piuttosto che delle concentrazioni assolute dei composti in un ampio intervallo dinamico. La maggior parte delle tecniche analitiche utili per questi scopi utilizzano moduli di separazione GC o HPLC/UPLC accoppiati a uno spettrometro di massa veloce e preciso. Le separazioni GC richiedono una modifica chimica (derivatizzazione) prima dell’analisi e funzionano in modo efficiente per le piccole molecole. Le separazioni HPLC sono più adatte all’analisi di composti polari e non volatili nella loro forma nativa. Le tecniche basate sull’infusione diretta e sull’NMR sono per lo più utilizzate per il fingerprinting e la fenotipizzazione istantanea, ove applicabile. La scoperta e la convalida dei biomarcatori metabolici sono opportunità eccitanti e promettenti offerte dall’analisi metabolica applicata agli esperimenti biologici e biomedici. Abbiamo dimostrato che le tecniche GC-TOF-MS, HPLC/UPLC-RP-MS e HILIC-LC-MS utilizzate per l’analisi metabolica offrono una mappatura sufficiente del metaboloma fornendo ai ricercatori dati sicuri per la successiva analisi multivariata e il data mining.