Minamata, ciudad, Kumamoto ken (prefectura), sureste de Kyushu, Japón. Está situada cerca del extremo sur de la bahía de Yatsushiro.

Una ciudad de la compañía Nippon Chisso Hiryo, sus principales productos son los fertilizantes químicos, el carburo y el cloruro de vinilo. Minamata era tradicionalmente un puerto pesquero y tiene conexiones regulares por mar con la isla de Amakusa, la principal del archipiélago de Amakusa. En los alrededores hay fuentes termales.

Después de 1956 se reconoció una enfermedad, a veces mortal, que llegó a conocerse como «enfermedad de Minamata» entre los pescadores locales y sus familias. Se determinó que la causa era un compuesto orgánico de mercurio presente en los residuos vertidos por las fábricas químicas locales en el mar. Este compuesto se concentraba en el pescado y el marisco que luego consumían los habitantes locales. Las víctimas de la enfermedad sufren un envenenamiento por mercurio que puede provocar retraso mental, graves defectos de nacimiento, pérdida de la vista y del oído, parálisis y muerte. La enfermedad de Minamata, la primera cuya causa se reconoció como la contaminación industrial del agua de mar, despertó la preocupación mundial e hizo mucho para estimular el desarrollo del movimiento de protección del medio ambiente. En julio de 1997 se determinó que la bahía de Minamata estaba libre de mercurio. Se retiraron las redes diseñadas para evitar que sus peces nadaran en las aguas circundantes. Población. (2005) 29,119; (2010) 26,978.