Minamata, stad, Kumamoto ken (prefectuur), zuidoostelijk Kyushu, Japan. Het ligt in de buurt van het zuidelijke uiteinde van de Yatsushiro-baai.

Een bedrijfsstad van de Nippon Chisso Hiryo Company, met als belangrijkste producten chemische meststoffen, carbide en vinylchloride. Minamata was van oudsher een vissershaven en heeft regelmatige zeeverbindingen met het eiland Amakusa, het hoofdeiland van de Amakusa archipel. In de omgeving zijn warmwaterbronnen te vinden.

Na 1956 werd onder de plaatselijke vissers en hun gezinnen een soms dodelijke ziekte onderkend die bekend kwam te staan als de “Minamata-ziekte”. De oorzaak werd gezocht in een organische kwikverbinding in afval dat door plaatselijke chemische fabrieken in zee werd geloosd. Deze verbinding werd geconcentreerd in vis en schaaldieren die vervolgens door de plaatselijke bevolking werden geconsumeerd. Slachtoffers van de ziekte lijden aan kwikvergiftiging, die kan leiden tot mentale achterstand, ernstige geboorteafwijkingen, gezichts- en gehoorverlies, verlamming en de dood. De Minamata-ziekte, de eerste ziekte waarvan de oorzaak werd herkend als industriële verontreiniging van het zeewater, wekte wereldwijd bezorgdheid en was een belangrijke stimulans voor de ontwikkeling van de milieubeschermingsbeweging. Sinds juli 1997 is de Minamata-baai kwikvrij. De netten die moesten voorkomen dat de vissen in de omringende wateren zouden zwemmen, zijn verwijderd. Aantal inwoners. (2005) 29,119; (2010) 26,978.