Toen de Qing-regering hoorde van de Mongoolse missie naar Rusland, gaf zij Sando de opdracht een onderzoek in te stellen. Sando ontbood onmiddellijk het hoofd van de kerkelijke administratie van de Khutukhtu (Ikh shav’), de Erdene Shanzav, en eiste een verklaring. De Erdene Shanzav, die zei dat hij er niet bij betrokken was, onthulde het hele complot. Sando eiste toen dat de Khutuktu zijn verzoek om Russische troepen zou intrekken. De Khutuktu stemde toe, op voorwaarde dat Sando de Nieuwe Administratie zou ontmantelen. Sando stuurde een telegram naar Peking voor instructies, en kreeg te horen dat delen van de Nieuwe Administratie konden worden uitgesteld.
Sando beval de prinsen in Urga een verklaring te ondertekenen dat slechts een paar personen verantwoordelijk waren geweest voor het beroep op Rusland. De prinsen legden een dergelijke verklaring af, maar alleen mondeling. Sando beval de Mongolen vervolgens geen contact meer te hebben met het Russische consulaat en dreigde bij ongehoorzaamheid 500 extra manschappen naar Urga te sturen en de Chinese bevolking van de stad te bewapenen. Hij plaatste wachtposten rond het paleis van de Khutuktu met het bevel Russische bezoekers te weren. En hij stuurde een contingent troepen naar de Russisch-Mongoolse grens om de Mongoolse delegatie naar Rusland bij haar terugkeer te onderscheppen.
Evenementen van seismische proporties vonden toen plaats in China zelf. Op 10 oktober brak er een opstand uit in Wuchang en was er een revolutie begonnen tegen de heersende minderheidsklasse. De ene na de andere provincie verklaarde zich onafhankelijk van het Qing-gezag. Sando was van mening dat zijn positie onhoudbaar was en stuurde een telegram naar de regering in Peking om toestemming te vragen ontslag te nemen, maar zijn verzoek werd afgewezen. Ondertussen keerde de Mongoolse delegatie naar Rusland in het geheim terug en bracht verslag uit over de resultaten van haar reis aan een groep prinsen en lama’s. Zij stelden een gezamenlijke memorie op voor de Khutukhtu met de vraag wat Mongolië moest doen in plaats van de provinciale opstanden. Hij raadde de Mongolen aan een eigen staat te vormen.
Gemoedigd door de steun van de Khutuktu en door de dreigende ineenstorting van de Qing-dynastie, werd de Voorlopige Regering van Khalkha gevormd, geleid door enkele vooraanstaande Khalkha edelen. Op 28 november gaf de regering alle vier de provincies (aimag) van Khalkha opdracht elk duizend soldaten te mobiliseren. Vrijwel onmiddellijk hadden 500 mannen van de naburige khoshuuns zich in Urga verzameld. Twee dagen later ontving Sando een brief, ondertekend in naam van de edelen en lama’s van Khalkha, waarin stond dat zij gehoord hadden van een afscheidingsbeweging in China, en dat Chinese troepen van de “revolutionaire partij” voorbereidingen troffen om vanuit Binnen-Mongolië naar Urga op te rukken. In de brief staat verder dat de Khutuktu, gezien de voordelen die de Khalkha’s in het verleden van de Qing hadden verkregen, opdracht had gegeven tot de mobilisatie van 4000 manschappen om op te rukken naar Peking ter verdediging van de keizer. Sando werd gevraagd deze mannen te voorzien van proviand en wapens. Hij kreeg drie uur om te antwoorden. Er kwam geen antwoord. Dit dunne bedrog achterlatend, bezocht een delegatie van edelen en lama’s het kantoor van de amban, en bracht hem op de hoogte van hun besluit de onafhankelijkheid uit te roepen en de Khutuktu als keizer te installeren. Sando smeekte de delegatie. Hij gaf toe dat de gebeurtenissen het gevolg waren van zijn eigen dwaasheid en beloofde Mongolië volledige autonomie aan te bevelen, maar geen onafhankelijkheid. De delegatie antwoordde kortaf dat zij enkel gekomen was om een boodschap over te brengen, niet om erover te debatteren. Sando werd bevolen het land binnen 24 uur te verlaten.
Er was weinig dat Sando kon doen. Hij had slechts 150 manschappen, die in ieder geval in een weerspannige stemming waren vanwege achterstallig achterstallig loon. De volgende dag werden zijn soldaten ontwapend door Mongoolse militieleden, evenals Russische Kozakken van het consulaire konvooi onder bevel van Grigorij Semjonov, de toekomstige Ataman. Sando en zijn staf verhuisden voor hun eigen veiligheid naar de compound van het Russische consulaat.
Op 30 november 1911 stelden de Mongolen de Tijdelijke Regering van Khalkha in. Op 5 december verliet Sando Mongolië onder Russisch escorte. Het Chinese gezag in de rest van het land stortte daarna snel in. Later die maand of in januari 1912 (de bronnen lopen uiteen) vertrokken de militaire gouverneur van Uliastai in West-Mongolië, zijn staf en militaire bewakers, vreedzaam onder bescherming van Kozakkentroepen. De plaatsvervangende militaire gouverneur van Khovd besloot echter weerstand te bieden, hopend op versterkingen uit Xinjiang. De troepen kwamen te laat : de stad werd omsingeld door Mongoolse troepen, het versterkingsdetachement werd verpletterd. In augustus 1912 werd zijn bolwerk door Mongoolse troepen overwonnen, en hij en zijn staf werden door Kozakken het land uitgeleid.
Op 1 december vaardigde de Voorlopige Regering van Chalkha een algemene proclamatie uit waarin het einde van het Qing-bewind werd aangekondigd en de instelling van een theocratie onder de Jebtsundamba Khutuktu. Aan het einde van de maand, op 29 december, werd de Khutuktu officieel geïnstalleerd als Bodg Khaan (“Grote Khan”, of “Keizer”) van de nieuwe Mongoolse staat. Dit luidde het tijdperk van Bogd Khan in. Hoewel alle Barga, Dariganga, Khovd, Huvsgul regio, 26 hoshuns van Ili regio (Dzungarian Oirads), 24 hoshuns van Boven-Mongolië 29 hoshuns, 35 hoshuns van Binnen-Mongolië 49 hoshuns verklaringen stuurden om Bogd Khan’s oproep tot Mongoolse hereniging te steunen, waren de meesten van hen in werkelijkheid echter te voorzichtig of te besluiteloos om te proberen zich aan te sluiten bij het regime van Bogd Khan.
De Mongoolse revolutie was voor het grootste deel een ordelijke machtsoverdracht. Het relatief vreedzame karakter ervan was te danken aan het realisme van de Qing-autoriteiten in Mongolië, en niet in het minst aan de aanwezigheid van Russische troepen, die bescherming boden aan deze autoriteiten en de Chinese troepen. De situatie was anders in Binnen-Mongolië. Daar bleven de Chinese autoriteiten aan de macht, ook al maakten Mongoolse activisten zich op om zich bij Buiten-Mongolië aan te sluiten in de onafhankelijkheid. Leden van de koninklijke pro-Qing partij waren voorstander van de onafhankelijkheid van Binnen-Mongolië, en sommigen pleitten voor een monarchistische staat die zowel Mantsjoerije als Buiten- en Binnen-Mongolië omvatte. Gungsangnorbu, de leider van de Harqin Banner van Binnen-Mongolië, legde in december 1911 nauwe contacten met de Japanners. Hij en andere Binnen-Mongoolse prinsen namen leningen aan, beloofden de Japanners mijnbouwrechten en ontvingen grote wapenzendingen.