Colite linfocítica, anteriormente denominada “colite microscópica”, é uma síndrome clinicopatológica de diarreia aquosa, colonoscopia grosseiramente normal, e alterações inflamatórias das mucosas. Como a colite linfocítica é uma entidade nova e incompletamente caracterizada, foi realizado um estudo histopatológico para comparar colite linfocítica (n = 16), colite colágena (n = 17), doença inflamatória intestinal idiopática (n = 16), colite aguda (n = 16) e cólon histologicamente normal (n = 12). O estudo foi uma análise semiquantitativa cega das características histológicas do epitélio superficial, da lâmina própria e das criptas. A característica mais distintiva da colite linfocítica foi o aumento dos linfócitos intra-epiteliais, particularmente no epitélio superficial (P = .0001 v doença inflamatória intestinal idiopática, colite aguda e cólon normal). Outras características proeminentes da colite linfocítica incluem danos epiteliais superficiais (P inferior a .005 v doença inflamatória intestinal idiopática e cólon normal), aumento da inflamação crônica da lâmina própria (P inferior a .01 v normal), e distorção mínima da cripta ou criptite ativa. Houve semelhanças impressionantes entre colite linfocítica e colite colágena, mas o espessamento subepitelial do colágeno foi observado apenas na colite colágena. A doença inflamatória intestinal idiopática mostrou distorção proeminente da cripta e maior inflamação ativa, além de linfócitos intra-epiteliais mínimos. A colite aguda ocasionalmente demonstrou danos epiteliais superficiais proeminentes, mas era diferente da colite linfocítica. Chegamos às seguintes conclusões: (1) a entidade “colite microscópica” mostra histopatologia característica incluindo infiltração linfocítica proeminente do epitélio, e assim, uma designação mais apropriada é colite linfocítica; (2) embora a colite linfocítica se assemelhe muito à colite colágena, cada entidade é distinta na biópsia; e (3) a colite linfocítica é facilmente distinguível da doença inflamatória intestinal idiopática, formas agudas de colite e colorectum normal.