Als die Qing-Regierung von der mongolischen Mission in Russland erfuhr, beauftragte sie Sando mit einer Untersuchung. Sando rief sofort den Leiter der kirchlichen Verwaltung (Ikh shav‘) von Khutukhtu, den Erdene Shanzav, zu sich und forderte eine Erklärung. Der Erdene Shanzav beteuerte, er sei nicht beteiligt gewesen, und enthüllte das gesamte Komplott. Sando verlangte daraufhin, dass der Khutuktu sein Ersuchen um russische Truppen zurückzieht. Die Khutuktu willigten ein, unter der Bedingung, dass Sando die Neue Verwaltung auflöst. Sando telegrafierte nach Peking, um Anweisungen zu erhalten, und ihm wurde mitgeteilt, dass Teile der Neuen Verwaltung aufgeschoben werden könnten.
Sando befahl den Fürsten in Urga, eine Erklärung zu unterzeichnen, dass nur einige wenige Personen für den Aufruf an Russland verantwortlich gewesen seien. Die Fürsten gaben zwar eine solche Erklärung ab, aber nur mündlich. Daraufhin befahl Sando den Mongolen, keinen weiteren Kontakt mit dem russischen Konsulat aufzunehmen, und drohte für den Fall des Ungehorsams damit, weitere 500 Soldaten nach Urga zu bringen und die chinesische Bevölkerung in der Stadt zu bewaffnen. Er postierte Wachen um den Palast des Khutuktu mit dem Befehl, russische Besucher auszusperren. Und er schickte ein Truppenkontingent an die russisch-mongolische Grenze, um die mongolische Delegation bei ihrer Rückkehr nach Russland abzufangen.
In China selbst fanden zu dieser Zeit Ereignisse von seismischem Ausmaß statt. Am 10. Oktober kam es zu einem Aufstand in Wuchang, und eine Revolution gegen die herrschende Minderheit hatte begonnen. Eine Provinz nach der anderen erklärte ihre Unabhängigkeit von der Qing-Behörde. Sando glaubte, dass seine Position unhaltbar war, und bat die Regierung in Peking um die Erlaubnis, zurückzutreten, was jedoch abgelehnt wurde. In der Zwischenzeit kehrte die mongolische Delegation heimlich nach Russland zurück und berichtete einer Gruppe von Prinzen und Lamas über die Ergebnisse ihrer Reise. Sie verfassten ein gemeinsames Memorial an den Khutukhtu, in dem sie fragten, was die Mongolei anstelle der Provinzaufstände tun sollte. Er riet den Mongolen, einen eigenen Staat zu gründen.
Gestärkt durch die Unterstützung des Khutuktu und den drohenden Zusammenbruch der Qing-Dynastie wurde die provisorische Regierung von Chalkha gebildet, an deren Spitze einige prominente Adlige aus Chalkha standen. Am 28. November ordnete die Regierung an, dass alle vier Provinzen (aimag) von Chalkha jeweils tausend Soldaten mobilisieren sollten. Fast sofort versammelten sich 500 Männer aus den benachbarten Khoshuuns in Urga. Zwei Tage später erhielt Sando ein Schreiben, das im Namen der Adligen und Lamas von Chalkha unterzeichnet war und in dem es hieß, dass sie von einer Abspaltungsbewegung in China gehört hätten und dass sich chinesische Truppen der „revolutionären Partei“ darauf vorbereiteten, von der Inneren Mongolei aus auf Urga zu marschieren. Weiter heißt es in dem Brief, dass die Khutuktu angesichts der Vorteile, die die Chalkhas in der Vergangenheit von den Qing erhalten hatten, die Mobilisierung von 4000 Soldaten angeordnet hatten, die zur Verteidigung des Kaisers auf Peking vorrücken sollten. Sando wurde gebeten, diese Männer mit Proviant und Waffen zu versorgen. Ihm wurde eine Frist von drei Stunden gesetzt, um zu antworten. Er erhielt keine Antwort. Eine Delegation von Adligen und Lamas suchte das Büro des Ambans auf und teilte ihm ihre Entscheidung mit, die Unabhängigkeit zu erklären und die Khutuktu als Kaiser einzusetzen. Sando flehte die Delegation an. Er gab zu, dass das, was geschehen war, das Ergebnis seiner eigenen Torheit war, und versprach, der Mongolei volle Autonomie, aber nicht die Unabhängigkeit zu empfehlen. Die Delegation entgegnete knapp, sie sei nur gekommen, um eine Botschaft zu überbringen, nicht um darüber zu diskutieren. Sando wurde angewiesen, das Land innerhalb von 24 Stunden zu verlassen.
Sando konnte nur wenig tun. Er verfügte nur über 150 Soldaten, die wegen ausstehender Soldzahlungen ohnehin in einer widerspenstigen Stimmung waren. Am nächsten Tag wurden seine Soldaten von mongolischen Milizionären und russischen Kosaken des Konsularkonvois unter dem Kommando von Grigori Semjonow, dem späteren Ataman, entwaffnet. Sando und sein Stab zogen zu ihrer eigenen Sicherheit in das Gelände des russischen Konsulats.
Am 30. November 1911 errichteten die Mongolen die provisorische Regierung von Khalkha. Am 5. Dezember verließ Sando mit russischer Eskorte die Mongolei. Die chinesische Autorität im Rest des Landes brach daraufhin schnell zusammen. Noch im selben Monat oder im Januar 1912 (es gibt unterschiedliche Quellen) verließen der Militärgouverneur von Uliastai in der Westmongolei, sein Stab und seine Militärgarde friedlich und unter dem Schutz von Kosakentruppen das Land. Der stellvertretende Militärgouverneur von Chowd beschloss jedoch, Widerstand zu leisten, da er auf Verstärkung aus Xinjiang hoffte. Die Truppen kamen zu spät: Die Stadt wurde von mongolischen Truppen umzingelt, die Verstärkungstruppe wurde zerschlagen. Im August 1912 wurde seine Festung von mongolischen Truppen eingenommen, und er und sein Stab wurden von Kosaken außer Landes eskortiert.
Am 1. Dezember gab die provisorische Regierung von Chalkha eine allgemeine Proklamation heraus, in der sie das Ende der Qing-Herrschaft und die Errichtung einer Theokratie unter dem Jebtsundamba Khutuktu ankündigte. Am Ende des Monats, am 29. Dezember, wurde der Khutuktu offiziell als Bodg Khaan („Großkhan“ oder „Kaiser“) des neuen mongolischen Staates eingesetzt. Damit wurde die Ära des Bogd Khan eingeläutet. Während alle Barga, Dariganga, Khovd, Huvsgul Region, 26 hoshuns der Ili Region (Dzungarian Oirads), 24 hoshuns aus der Obermongolei 29 hosnuns, 35 hoshuns aus der Inneren Mongolei 49 hoshuns schickten Erklärungen, um Bogd Khans Aufruf der mongolischen Wiedervereinigung zu unterstützen, in Wirklichkeit jedoch waren die meisten von ihnen zu vorsichtig oder unentschlossen, um zu versuchen, sich dem Bogd Khan Regime anzuschließen.
Die mongolische Revolution war größtenteils eine geordnete Machtübergabe. Dass sie relativ friedlich verlief, lag am Realismus der Qing-Behörden in der Mongolei und nicht zuletzt an der Anwesenheit russischer Truppen, die diesen Behörden und den chinesischen Truppen Schutz boten. In der Inneren Mongolei war die Situation anders. Dort blieben die chinesischen Behörden an der Macht, obwohl sich mongolische Aktivisten darauf vorbereiteten, sich der Äußeren Mongolei anzuschließen und unabhängig zu werden. Mitglieder der königstreuen Pro-Qing-Partei waren dafür bekannt, dass sie die Unabhängigkeit der Inneren Mongolei unterstützten, und einige plädierten für einen monarchistischen Staat, der sowohl die Mandschurei als auch die Äußere und Innere Mongolei umfasste. Vor allem Gungsangnorbu, der Führer des inner-mongolischen Harqin-Banners, knüpfte im Dezember 1911 enge Kontakte zu den Japanern. Er und andere Fürsten der Inneren Mongolei nahmen Kredite auf, versprachen den Japanern Schürfrechte und erhielten umfangreiche Waffenlieferungen.