Shakira wurde in Barranquilla, Kolumbien geboren. Sie ist das einzige Kind von Nidia Ripoll und William Mebarak Chadid. Ihre Großeltern väterlicherseits sind aus dem Libanon nach New York City ausgewandert, wo ihr Vater geboren wurde. Von ihrer Mutter, Nidia Ripoll, hat sie spanische (katalanische und kastilische) und italienische Abstammung. Sie hat acht ältere Halbgeschwister aus einer früheren Ehe ihres Vaters. Shakira verbrachte einen Großteil ihrer Jugend in Barranquilla, einer Stadt an der nördlichen Karibikküste von Kolumbien. Shakira schrieb ihr erstes Gedicht mit dem Titel „La Rosa De Cristal“ („Die Kristallrose“), als sie erst vier Jahre alt war. Als sie aufwuchs, sah sie fasziniert zu, wie ihr Vater Geschichten auf einer Schreibmaschine schrieb, und wünschte sich eine solche zu Weihnachten als Geschenk. Im Alter von sieben Jahren bekam sie eine Schreibmaschine und schrieb seither Gedichte. Diese Gedichte entwickelten sich schließlich zu Liedern. Als Shakira zwei Jahre alt war, kam ein älterer Halbbruder bei einem Motorradunfall ums Leben, und im Alter von acht Jahren schrieb Shakira ihr erstes Lied mit dem Titel „Tus gafas oscuras“ („Deine dunkle Brille“), das von ihrem Vater inspiriert war, der jahrelang eine dunkle Brille trug, um seinen Kummer zu verbergen.