Ottomaanien valtakunta piti yllä läheisiä suhteita läheisiin italialaisiin kaupunkivaltioihin 1500- ja 1600-luvuilla. Mehmed II Valloittajan henkilökohtainen lääkäri Yacub pasa (1425-1481) oli italialainen juutalainen, joka nousi pasan ja visiirin arvonimeen. Domenico Hierosolimitano (n. 1552-1622), sulttaani Murad III:n kolmas lääkäri, oli jerusalemilainen rabbi. Hänen kirjansa on tärkeä lähde Istanbulin jokapäiväisestä elämästä ja lääketieteellisestä käytännöstä tuohon aikaan. Nuh bin Abd al-Mennab (1627-1707), myös italialaista syntyperää, oli Osmanien valtakunnan ylilääkäri, joka käänsi farmakopean turkkilaiseksi. Samalla vuosisadalla kahdesta italialaisesta, Israel Coneglianosta (Conian) ja Tobia Cohenista tuli johtavien ottomaanien pashojen ja suurvisiirin yksityislääkäreitä. A. Vuccino (1829-1893) ja Antoine Calleja Pasha (1806-1893) opettivat Istanbulin lääketieteellisessä koulussa. Italia oli ottomaanien länsimaistumisen alkuvaiheessa suosittua maata lääkärikoulutuksen kannalta. Sanizade Mehmet Ataullah Efendi (1771-1826) käänsi ensimmäisen ottomaanien valtakunnassa painetun lääketieteellisen kirjan italiasta turkkiin. Mustafa Behcet Efendi (1774-1833), sulttaanin ylilääkäri ja Turkin ensimmäisen länsimaisen lääketieteellisen koulun perustaja, käänsi useita lääketieteellisiä kirjoja italiasta turkkiin. Osmanien valtakunnan ensimmäinen painettu farmakopea oli myös alun perin italialainen. 1800-luvulla Edouard Ottoni ja hänen poikansa Giuseppe Ottoni olivat tunnettuja sotilasfarmaseutteja, molemmat nimellä Faik Pasha. Todennäköisesti vaikutusvaltaisin italialaistaustainen lääkäri oli Giovanni Battista Violi (1849-1928), joka oli harjoittanut lastenlääketiedettä Turkissa yli viidenkymmenen vuoden ajan. Violi oli ottomaanien valtakunnan ensimmäisen lastensairaalan, ensimmäisen rokotuslaitoksen ja ensimmäisen lastenlääkärilehden perustaja.