Minamata, kaupunki, Kumamoto ken (prefektuuri), Kaakkois-Kyushu, Japani. Se sijaitsee lähellä Yatsushiro-lahden eteläpäätä.

Nippon Chisso Hiryo Companyn yrityskaupunki, jonka päätuotteita ovat kemialliset lannoitteet, karbidi ja vinyylikloridi. Minamata oli perinteisesti kalastussatama, ja siitä on säännölliset merireittiyhteydet Amakusan saarelle, joka on Amakusan saariston pääsaari. Lähistöllä on kuumia lähteitä.

Vuoden 1956 jälkeen paikallisten kalastajien ja heidän perheidensä keskuudessa havaittiin joskus kuolemaan johtanut sairaus, joka tuli tunnetuksi nimellä ”Minamatan tauti”. Syyksi todettiin paikallisten kemiantehtaiden mereen päästämien jätteiden sisältämä orgaaninen elohopeayhdiste. Tämä yhdiste konsentroitui kaloihin ja äyriäisiin, joita paikalliset asukkaat söivät. Taudin uhrit kärsivät elohopeamyrkytyksestä, joka voi johtaa kehitysvammaisuuteen, vakaviin synnynnäisiin epämuodostumiin, näön ja kuulon heikkenemiseen, halvaantumiseen ja kuolemaan. Minamatan tauti oli ensimmäinen sairaus, jonka syyksi tunnustettiin meriveden teollinen saastuminen, ja se herätti maailmanlaajuista huolta ja vaikutti paljon ympäristönsuojeluliikkeen kehittymiseen. Minamata Bayn todettiin olevan elohopeavapaa heinäkuussa 1997. Verkot, joiden tarkoituksena oli estää sen kalojen uiminen ympäröiviin vesiin, poistettiin. Väestö. (2005) 29,119; (2010) 26,978.