Mini ReviewThe current understanding of KRAS protein structure and dynamics

, Author

Yksi yleisimmistä syövän aiheuttajista on mutantti KRAS-proteiini. Vielä vähän aikaa sitten KRAS:ia pidettiin lääkitsemättömänä onkoproteiinina. Pitkän kamppailun jälkeen tunnelin päässä näkyy kuitenkin vihdoin valoa, sillä lupaavia KRAS-kohdistettuja hoitoja on kliinisissä tutkimuksissa tai lähestyy niitä. Viime vuosina yhdessä RAS-lääkkeiden löytämisessä tapahtuneen lupaavan edistyksen kanssa ymmärryksemme KRAS:sta on lisääntynyt valtavasti. Tähän edistykseen on liittynyt julkisesti saatavilla olevien KRAS-rakenteiden lisääntyminen, sillä alle kymmenen vuotta sitten niitä oli vain yhdeksän. Lisäksi jatkuvasti lisääntyvä laskentakapasiteetti on mahdollistanut biologisesti merkittävien aikaskaalojen käytön, minkä ansiosta molekyylidynamiikkasimulaatioilla (MD-simulaatioilla) voidaan tutkia KRAS-proteiinin dynamiikkaa entistä yksityiskohtaisemmin atomistisella tasolla. Tässä minikatsauksessa tavoitteenani on antaa lukijalle yleiskatsaus julkisesti saatavilla olevaan KRAS:n rakennetietoon, kokeiden paljastamaan konformaatiodynamiikkaan ja siihen, mitä olemme oppineet MD-simulaatioista. Käsittelen myös nykyisten tietojen rajoituksia ja annan ehdotuksia KRAS:iin liittyvää tulevaa tutkimusta varten, joka täyttäisi nykyisiä aukkoja tietämyksessämme ja antaisi ohjeita tämän arvoituksellisen onkoproteiinin tulkitsemiseksi.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.