Kuultuaan mongolien lähetystöstä Venäjälle Qingin hallitus antoi Sandolle tehtäväksi tutkia asiaa. Sando kutsui välittömästi koolle Khüreen kirkollisen hallinnon (Ikh shav’) johtajan, Erdene Shanzavin, ja vaati selitystä. Erdene Shanzav vetosi siihen, että hän ei ollut osallisena, ja paljasti koko juonen. Tämän jälkeen Sando vaati Khutuktua perumaan pyyntönsä venäläisistä joukoista. Khutuktu suostui edellyttäen, että Sando hajottaa uuden hallinnon. Sando kaapeloi Pekingiin saadakseen ohjeita, ja hänelle kerrottiin, että osia Uudesta hallinnosta voitiin lykätä.
Sando määräsi Urgan ruhtinaat allekirjoittamaan lausunnon, jonka mukaan vain muutama henkilö oli ollut vastuussa Venäjään vetoamisesta. Ruhtinaat antoivat tällaisen julistuksen, mutta vain suullisesti. Tämän jälkeen Sando määräsi mongoleja olemaan enää missään yhteydessä Venäjän konsulaattiin ja uhkasi tottelemattomuuden sattuessa tuoda Urgaan 500 sotilasta lisää ja aseistaa kaupungin kiinalaisväestön. Hän asetti vartijoita Khutuktun palatsin ympärille ja käski estää venäläisten vierailijat. Ja hän lähetti joukko-osaston Venäjän ja Mongolian rajalle pysäyttämään Mongolian valtuuskunnan Venäjälle palatessaan.
Seismisiä mittasuhteita omaavat tapahtumat olivat tuolloin käynnissä itse Kiinassa. Lokakuun 10. päivänä Wuchangissa oli tapahtunut kansannousu, ja vallankumous vähemmistön hallitsevaa luokkaa vastaan oli alkanut. Yksi maakunta toisensa jälkeen julisti itsenäisyytensä Qingin vallan alaisuudesta. Sando uskoi, että hänen asemansa oli kestämätön, ja lähetti Pekingin hallitukselle sähkeen, jossa hän pyysi lupaa erota, mutta hänen pyyntönsä hylättiin. Sillä välin Mongolian valtuuskunta palasi salaa Venäjälle ja raportoi matkansa tuloksista ryhmälle ruhtinaita ja laamoja. He laativat Khutukhtulle yhteisen muistion, jossa kysyttiin, mitä Mongolian tulisi tehdä maakuntakapinoiden sijasta. Hän neuvoi, että mongolialaiset muodostaisivat oman valtion.
Khutuktun tuesta ja Qing-dynastian lähestyvästä romahduksesta rohkaistuneena muodostettiin Khalkhan väliaikainen hallitus, jota johtivat eräät merkittävät khalkha-aateliset. Marraskuun 28. päivänä hallitus määräsi kaikki neljä Khalkhan maakuntaa (aimag) mobilisoimaan tuhat sotilasta kukin. Lähes välittömästi Urgaan oli kokoontunut 500 miestä naapurimaiden khoshuuneista. Kaksi päivää myöhemmin Sando sai kirjeen, joka oli allekirjoitettu Khalkhan aatelisten ja laamojen nimissä ja jossa todettiin, että he olivat kuulleet Kiinassa tapahtuvasta separatistisesta liikkeestä ja että ”vallankumouksellisen puolueen” kiinalaiset joukot valmistautuivat marssimaan Urgaan Sisä-Mongoliasta. Kirjeessä todettiin edelleen, että ottaen huomioon khalkhien Qingiltä aiemmin saaman hyödyn, khutuktu oli määrännyt 4000 sotilaan liikekannallepanon etenemään Pekingiin keisaria puolustamaan. Sandoa pyydettiin toimittamaan näille miehille elintarvikkeita ja aseita. Hänelle annettiin kolme tuntia aikaa vastata. Vastausta ei tullut. Hylätessään tämän ohuen petoksen aatelisista ja laamoista koostuva valtuuskunta vieraili ambanin toimistossa ja ilmoitti hänelle päätöksestään julistaa itsenäisyys ja asettaa Khutuktu keisariksi. Sando vetosi valtuuskuntaan. Hän myönsi, että se, mitä oli tapahtunut, oli hänen oman tyhmyytensä seurausta, ja hän lupasi suositella Mongolialle täyttä autonomiaa, mutta ei itsenäisyyttä. Valtuuskunta vastasi lyhytsanaisesti, että se oli tullut vain toimittamaan viestin, ei keskustelemaan siitä. Sando määrättiin lähtemään maasta 24 tunnin kuluessa.
Sando ei voinut tehdä juuri mitään. Hänellä oli vain 150 sotilasta, jotka olivat joka tapauksessa vastahakoisella tuulella maksamattomien palkkarästien vuoksi. Seuraavana päivänä hänen sotilaansa riisuivat aseista mongolialaiset miliisimiehet sekä Grigori Semjonovin, tulevan atamaanin, komennossa olleen konsulaattisaattueen venäläiset kasakat. Sando ja hänen esikuntansa siirtyivät Venäjän konsulaatin alueelle oman turvallisuutensa vuoksi.
Mongolit perustivat 30. marraskuuta 1911 Khalkhaan väliaikaisen hallituksen. Joulukuun 5. päivänä Sando lähti Mongoliasta venäläisten saattamana. Kiinan valta muualla maassa romahti nopeasti tämän jälkeen. Myöhemmin samassa kuussa tai tammikuussa 1912 (lähteet eroavat toisistaan) Länsi-Mongoliassa sijaitsevan Uliastain sotilaskuvernööri esikuntineen ja sotilaskaartilaisineen poistui rauhanomaisesti kasakkajoukkojen suojeluksessa. Khovdin apulaissotilaskuvernööri päätti kuitenkin vastustaa ja toivoi vahvistuksia Xinjiangista. Joukot tulivat liian myöhään: Mongolian joukot saartoivat kaupungin, vahvistusosasto murskattiin. Elokuussa 1912 mongolijoukot valtasivat hänen linnakkeensa, ja kasakat saattoivat hänet ja hänen esikuntansa pois maasta.
Joulukuun 1. päivänä Khalkhan väliaikainen hallitus antoi yleisen julistuksen, jossa ilmoitettiin Qing-hallinnon päättymisestä ja teokratian perustamisesta Jebtsundamba Khutuktun johdolla. Kuukauden lopussa, 29. joulukuuta, Khutuktu asetettiin virallisesti uuden mongolivaltion Bodg Khaaniksi (”suurkaani” tai ”keisari”). Tämä aloitti Bogd Khanin aikakauden. Vaikka kaikki Bargan, Darigangan, Khovdin, Huvsgulin alueen, Ilin alueen 26 hoshunia (dzungarialaiset oiradit), 24 hoshunia Ylä-Mongolian 29 hoshunista, 35 hoshunia Sisä-Mongolian 49 hoshunista lähettivät lausunnot tukeakseen Bogd Khanin vetoomusta mongolien jälleenyhdistymisestä, todellisuudessa suurin osa heistä oli kuitenkin liian varovaisia tai epäröiviä yrittäessään liittyä Bogd Khanin hallintoon.
Mongolien vallankumous oli suurimmaksi osaksi hallittu vallansiirto. Sen suhteellisen rauhallinen luonne johtui Mongoliassa toimivien Qing-viranomaisten realismista ja ei vähäisessä määrin venäläisten joukkojen läsnäolosta, jotka tarjosivat suojaa näille viranomaisille ja kiinalaisille joukoille. Tilanne oli erilainen Sisä-Mongoliassa. Siellä kiinalaiset viranomaiset pysyivät vallassa, vaikka mongoliaktivistit valmistautuivat liittymään Ulko-Mongolian kanssa itsenäisyyteen. Qingin kuninkaallisen puolueen jäsenten tiedettiin kannattavan Sisä-Mongolian itsenäisyyttä, ja jotkut kannattivat monarkistista valtiota, joka kattaisi Mantšurian sekä Ulko- ja Sisä-Mongolian. Erityisesti Sisä-Mongolian Harqin Bannerin johtaja Gungsangnorbu solmi läheiset suhteet japanilaisiin joulukuussa 1911. Hän ja muut Sisä-Mongolian ruhtinaat ottivat lainoja, lupasivat japanilaisille kaivosoikeuksia ja saivat merkittäviä asetoimituksia.