A guanóbányászat volt Shark Bay első szárazföldi iparága, amely 1850-ben elindította a terület európai betelepülését. A nyugat-ausztráliai gyarmat egyik legkorábbi kereskedelmi exportcikkét is ez biztosította.

A guano már a vegyi műtrágyák kifejlesztése előtt is értékes és keresett volt. A guanóra vonatkozó perui monopólium megfizethetetlenül drágává tette azt, így a Shark Bayben történt felfedezése kedvező fogadtatásra talált Ausztráliában és Európában.

A bányászat 1850-ben a Dirk Hartog-sziget keleti partjainál lévő Egg-szigeten kezdődött, majd a Henri Freycinet kikötő legalább 13 szigetére terjedt ki, és gyorsan le is fosztotta azokat. Ezek közé tartozott a Smith-, a Sunday- és az Eagle-sziget, valamint az északi és a déli Guano-sziget.

Az értékes árucikk védelmében a kormány 1850-ben helyőrséget hozott létre a Dirk Hartog-szigeten lévő Quoin Bluffnál. Később egy másik katonai előőrsöt hoztak létre a Heirisson-foknál.

A guano értékes volt, de a tét nagy volt. A rossz időjárás, a feltérképezetlen zátonyok és a bizonytalan horgonyzási helyek megnehezítették a nagy hajók dolgát. 1850-ben a 443 tonnás Prince Charlie bárka a Levillain-foknál a Levillain-foknál lévő Levillain-mélyedésbe ütközött, miután guanót rakodott. Ez a zátony 1878-ban a 125 tonnás Macquarie bárkát is megrongálta guanó rakománnyal. A hajótörést szenvedett matrózok visszaküzdötték magukat a Levillain-fokig, majd három napig gyalogoltak dél felé élelem és víz nélkül, amíg egy hajó meg nem mentette őket a Déli átjáróban.