Le miniere di guano furono la prima industria basata sulla terraferma a Shark Bay e iniziarono la colonizzazione europea dell’area nel 1850. Ha anche fornito alla colonia di Western Australia una delle sue prime esportazioni commerciali.
Il guano era prezioso e richiesto prima dello sviluppo dei fertilizzanti chimici. Un monopolio peruviano sul guano lo rendeva proibitivamente costoso, così la sua scoperta a Shark Bay fu ben accolta in Australia e in Europa.
L’estrazione iniziò nel 1850 a Egg Island al largo della costa orientale di Dirk Hartog Island, poi progredì verso, e rapidamente spogliò, almeno 13 isole nel porto di Henri Freycinet. Queste includevano le isole Smith, Sunday e Eagle, e le isole North e South Guano.
Ansioso di proteggere questo prezioso prodotto, il governo stabilì una guarnigione a Quoin Bluff sull’isola Dirk Hartog nel 1850. Un altro avamposto militare fu poi stabilito a Cape Heirisson.
Il guano era prezioso ma la posta in gioco era alta. Il cattivo tempo, le secche inesplorate e gli ancoraggi incerti lo rendevano difficile per le grandi navi. Nel 1850 l’imbarcazione Prince Charlie, di 443 tonnellate, colpì la secca di Levillain al largo di Capo Levillain dopo aver caricato il guano. Questa secca ha anche reclamato la barca Macquarie di 125 tonnellate con un carico di guano nel 1878. I marinai naufraghi hanno lottato fino a Capo Levillain poi hanno camminato verso sud per tre giorni senza cibo o acqua fino a quando sono stati salvati da una nave nel South Passage.