Imperiul Otoman a întreținut relații strânse cu orașele-stat italiene vecine în secolele al XVI-lea și al XVII-lea. Yacub Pașa (1425-1481), medicul personal al lui Mehmed al II-lea Cuceritorul, a fost un evreu italian care a avansat până la titlul de pașa și vizir. Domenico Hierosolimitano (cca. 1552-1622), al treilea medic al sultanului Murad al III-lea, a fost un rabin din Ierusalim. Cartea sa este o sursă importantă despre viața de zi cu zi și practica medicală din Istanbul la acea vreme. Nuh bin Abd al-Mennab (1627-1707), de asemenea de origine italiană, a fost medicul-șef al Imperiului Otoman, care a tradus o farmacopee în limba turcă. În același secol, doi italieni, Israel Conegliano (Conian) și Tobia Cohen, au devenit medicii privați ai unor pașați otomani de frunte și ai Marelui Vizir. A. Vuccino (1829-1893) și Antoine Calleja Pasha (1806-1893) au predat la Școala de Medicină din Istanbul. Italia a fost o țară favorită pentru educația medicală în perioada de început a occidentalizării otomane. Sanizade Mehmet Ataullah Efendi (1771-1826) a tradus din italiană în turcă prima carte medicală tipărită în Imperiul Otoman. Mustafa Behcet Efendi (1774-1833), medicul șef al sultanului și fondatorul primei școli de medicină occidentală din Turcia, a tradus mai multe cărți de medicină din italiană în turcă. Prima farmacopee tipărită în Imperiul Otoman a fost, de asemenea, inițial italiană În secolul al XIX-lea, Edouard Ottoni și fiul său Giuseppe Ottoni au fost farmaciști militari renumiți, ambii sub numele de Faik Pașa. Probabil că cel mai influent medic de origine italiană a fost Giovanni Battista Violi (1849-1928), care a practicat pediatria în Turcia timp de peste cincizeci de ani. Violi a fost fondatorul primului spital pentru copii, al primului institut de vaccinuri și al primei reviste de pediatrie din Imperiul Otoman.