Minamata, oraș, Kumamoto ken (prefectură), sud-estul Kyushu, Japonia. Este situat lângă capătul sudic al golfului Yatsushiro.

Oraș-companie a companiei Nippon Chisso Hiryo, principalele sale produse sunt îngrășămintele chimice, carbura și clorura de vinil. Minamata a fost în mod tradițional un port de pescuit și are conexiuni regulate pe cale maritimă cu insula Amakusa, insula principală a arhipelagului Amakusa. În apropiere se găsesc izvoare termale.

După 1956 a fost recunoscută în rândul pescarilor locali și al familiilor lor o boală uneori fatală care a ajuns să fie cunoscută sub numele de „boala Minamata”. Cauza a fost stabilită ca fiind un compus organo-mercuriu din deșeurile evacuate în mare de către fabricile chimice locale. Acest compus s-a concentrat în pești și crustacee care au fost apoi consumate de locuitorii din zonă. Victimele bolii suferă de otrăvire cu mercur, care poate duce la retard mintal, malformații congenitale grave, pierderea vederii și a auzului, paralizie și deces. Prima boală a cărei cauză a fost recunoscută ca fiind poluarea industrială a apei de mare, boala Minamata a stârnit îngrijorare la nivel mondial și a contribuit în mare măsură la stimularea dezvoltării mișcării de protecție a mediului. S-a stabilit că Golful Minamata nu mai conține mercur din iulie 1997. Plasele concepute pentru a împiedica peștii din această zonă să înoate în apele înconjurătoare au fost îndepărtate. Pop. (2005) 29,119; (2010) 26,978.