În 1920, Sesiunea Imperială a Shriners a avut loc în Portland, Oregon. În timpul acelei sesiuni, membrii au adoptat în unanimitate o rezoluție înaintată de W. Freeland Kendrick, care (în timp ce era Potentat Imperial) a înaintat rezoluția care a creat Spitalele Shriners pentru Copii. Primul spital din sistem a fost deschis în 1922 în Shreveport, Louisiana. Acesta a oferit îngrijiri ortopedice pediatrice.
Shriners Hospitals for Children a colaborat îndeaproape cu Comandamentul Sudic al Statelor Unite și cu alte comandamente militare, inclusiv cu armata și forțele aeriene, cu forța militară combinată din Guatemala și prin intermediul ambasadei SUA, cu Departamentul de Sănătate al SUA & Servicii Umane și cu Departamentul de Sănătate al SUA.Departamentul de Stat al S.U.A. pentru a aranja vizele medicale și transportul în Statele Unite, „cu un angajament global față de copiii din întreaga lume”.
În 1962, Shriners of North America a alocat 10 milioane de dolari pentru a înființa trei spitale specializate în tratamentul și reabilitarea copiilor arși. După ce au vizitat 21 de instituții medicale cu sediul în universități, s-a luat decizia de a construi primul lor spital pediatric pentru arși în campusul University of Texas Medical Branch din Galveston, Texas.
În 1994, Chronicle of Philanthropy, o publicație din domeniu, a publicat rezultatele celui mai mare studiu privind popularitatea și credibilitatea organizațiilor caritabile și non-profit. Studiul a arătat că spitalele Shriners au fost clasate pe locul 9 în topul „celor mai populare organizații caritabile/nonprofit din America” din peste 100 de organizații caritabile cercetate, 40% dintre americanii cu vârsta de peste 12 ani alegând „Iubesc” și „Îmi place foarte mult” pentru spitalele Shriners.
În septembrie 2008, Spitalul Shriner din Galveston a suferit pagube semnificative în urma uraganului Ike. În acel moment, spitalul a fost închis pentru renovare, iar îngrijirea copiilor cu arsuri acute a fost asigurată la alte spitale Shriners pentru copii. Shriners a luat în considerare închiderea unităților din Shreveport, Louisiana; Greenville, Carolina de Sud; Erie, Pennsylvania; Spokane, Washington; Springfield, Massachusetts și Galveston, Texas, eliminând un total de 225 de paturi. Cu toate acestea, în iulie 2009, Convenția Națională a Shriners a votat cu o majoritate covârșitoare împotriva închiderii oricărui spital și pentru repararea și redeschiderea unității din Galveston.
În 2009, în ciuda unei dotări care a scăzut de la 8 miliarde de dolari la 5 miliarde de dolari în mai puțin de un an din cauza economiei precare, Douglas Maxwell, directorul general al spitalelor, a declarat că el și alți Shriners sunt încrezători că sistemul spitalicesc va putea rămâne solvabil pe termen lung. Maxwell a declarat în iulie 2009 că unele dintre unități ar putea deveni centre chirurgicale ambulatorii și va începe să accepte plăți de asigurări (pentru majoritatea îngrijirilor) pentru prima dată în istoria de 87 de ani a spitalelor. Maxwell a declarat că copiii care suferă de arsuri, afecțiuni ortopedice, leziuni ale măduvei spinării și palate despicate vor continua să fie tratați fără costuri pentru familiile lor.
În mai 2015, Shriners Hospitals for Children a devenit membru al Mayo Clinic Care Network, o rețea națională de organizații care se angajează să servească mai bine pacienții și familiile acestora prin colaborarea cu medicii.
.