Kanske var Diocletianus program för inrikespolitiska reformer ännu viktigare för att upprätthålla imperiet. Han var inte en fullständig förnyare på detta område, för hans föregångare hade gjort några trevande försök i samma riktning; kejsaren Gallienus hade uteslutit senatorer från armén och separerat militära från civila karriärer. Senaten hade successivt berövats sina privilegier. Diocletianus systematiserade emellertid dessa arrangemang på ett sådant sätt att alla hans reformer ledde till ett slags centraliserad och absolut monarki som ställde effektiva handlingsmedel till hans förfogande. Sålunda utsåg Diocletianus konsulerna; senatorerna samarbetade inte längre vid stiftandet av lagar; de kejserliga rådgivarna (consilia sacra) fördelades på specialiserade ämbeten och deras funktioner definierades strikt så att praetorianprefekternas (kejsarens personliga livvakter) makt begränsades; specialiseringen av det administrativa arbetet växte; och antalet byråkrater ökade. Detta var början på den byråkrati och teknokrati som så småningom skulle komma att överskölja de moderna samhällena.
En sådan organisation gjorde det möjligt för förvaltningen att förlita sig mindre på enskilda människor och mer på tillämpningen av lagtexter. Det var faktiskt under Diocletianus regeringstid som de gregorianska och hermogeniska lagböckerna, av vilka endast fragment finns kvar, skrevs om. Men 1 200 bevarade omskrivningar visar en annan aspekt av kejsarens personlighet. Diocletianus, som var konservativ, var angelägen om att bevara de gamla dygderna: barnens skyldighet att försörja sina föräldrar på ålderns höst, föräldrarnas skyldighet att behandla sina barn rättvist, makarnas skyldighet att respektera äktenskapslagarna, sönernas skyldighet att inte vittna mot sina fäder, eller slavarnas skyldighet att vittna mot sina herrar, och skyddet av privategendom, borgenärers rättigheter och avtalsklausuler. Han förbjöd användningen av tortyr om sanningen kunde upptäckas på annat sätt och uppmuntrade guvernörerna att vara så självständiga som möjligt.
Hären omorganiserades också och fördes tillbaka till den gamla disciplinen. Sedentära trupper (lokala trupper) skickades till gränserna och den färdiga armén (huvudsakliga rörliga armén) gjordes inhemsk. Truppstyrkan ökades med en fjärdedel (inte multiplicerades med fyra som Lactantius hävdar). Även här genomsyrades Diocletianus’ reformer av en känsla för mänskliga realiteter; han befriade soldater från tjänstgöring efter 20 års tjänstgöring, och om han begränsade priset på varor för att minska levnadsomkostnaderna var det främst för att göra livet lättare för trupperna. Om man ska tro Lactantius delade Diocletianus upp provinserna ”för att göra sig själv mer fruktad”, men i själva verket var det för att föra guvernörerna närmare dem som de administrerade och, genom att fragmentera deras makt, minska deras territoriella styrka. Han åtog sig att underlätta den ekonomiska utvecklingen genom en återhämtning av jordbruket och ett byggnadsprogram.
Den här politiken var dyr, liksom krigen och arvet från en instabil finansiell situation. Diocletianus finanspolitiska lösningar diskuteras fortfarande; de utgör ett mycket svårt problem. Två nya skatter infördes, jugum och capitatio, den förstnämnda var en skatt på en enhet odlingsbar mark, den sistnämnda en skatt på individer. Skatterna togs ut proportionellt, och avgiftens storlek bestämdes av produktiviteten och typen av odling. I regel var det ett slags socioekonomisk beskattning som byggde på kopplingen mellan människor och mark i form av antingen ägande eller produktivitet. Bedömningar gjordes vart femte år; senare konsoliderades systemet till en cykel på 15 år som kallades indictio. Denna folkräkning av beskattningsbara vuxna gav upphov till våldsam kritik men hade den teoretiska fördelen att den ersatte de godtyckliga avgifterna från den tidigare eran. Förvisso var det finansiella systemet föremål för överdrifter, men Diocletianus syfte var att skaffa medel, och han skonade inte ens Italien, som fram till dess hade varit fritt från markbeskattning.
Denna reform åtföljdes av en monetär reform, som bland annat innebar återinförande av ett sunt guld- och silvermynt med fast utformning, skapande av ett nytt bronsmynt, cirkulation av små mynt för att underlätta det dagliga ekonomiska utbytet, decentralisering av myntningen och en ökning av antalet myntverk från 8 till 15.
Alla dessa åtgärder tenderade att avvärja finansiella kriser. Det berömda Edictum de Maximis Pretiis utfärdades år 301 e.Kr. och fastställde löner och maximipriser för att förhindra inflation, missbruk av vinster och exploatering av köpare. Omkring 1 000 artiklar räknades upp, och överträdelser kunde bestraffas med döden. Men trots detta var denna reglering av priser och löner inte verkställbar, och ediktet upphävdes senare.