Spänningarna ökade i hela södern under den första veckan i april 1861. Även om den övre södern ännu inte hade anslutit sig till konfederationen var Lincolns administration uppmärksam på de hotande krigsmolnen och möjligheten att stater, som Virginia, skulle lämna unionen. Marinminister Gideon Welles insåg att Gosport Navy Yard och ångskruvfregatten USS Merrimack var frestande mål för de separatistvänliga Virginiaborna. Följaktligen meddelade Welles den 10 april 1861 Gosport Navy Yard-kommendanten flaggofficer Charles Stewart McCauley att han måste visa stor vaksamhet för att skydda varvet. Han förklarade att det var viktigt att ett av den amerikanska flottans modernaste krigsfartyg, Merrimack, reparerades och flyttades till ett annat marinvarv. Welles tillade att McCauley inte skulle göra något som upprörde Virginians och att han skulle använda sitt bästa omdöme när han utförde sina plikter för att skydda Gosport. Welles avslutade med att det är ”önskvärt att det inte vidtas några åtgärder som ger onödig oro.”
Merrimack redo för sjöfart
Gosports kommendant svarade genom ett telegram den 11 april, där han uppgav att det skulle ta en månad att återuppliva Merrimacks demonterade motorer. Welles var chockad över McCauleys svar och kallade varvets kommendant för ”svag och inkompetent för krisen”. Han skickade US Navy’s chefsingenjör Benjamin Franklin Isherwood till Gosport för att förbereda Merrimack för sjösättning. Isherwood uppskattade att det skulle ta honom en vecka att reparera fartygets motorer. Kommendörkapten James Alden beordrades att följa med Isherwood och ta över befälet över fregatten. De anlände till Gosport Navy Yard den 14 april 1861. Isherwood satte omedelbart igång med att restaurera Merrimacks maskineri. Läs mer