Der Guano-Bergbau war die erste landgestützte Industrie in der Shark Bay und leitete die europäische Besiedlung des Gebiets im Jahr 1850 ein. Er versorgte die Kolonie Westaustralien auch mit einem ihrer ersten kommerziellen Exporte.

Guano war wertvoll und gefragt, bevor chemische Düngemittel entwickelt wurden. Ein peruanisches Monopol auf Guano machte es unerschwinglich, so dass seine Entdeckung in der Shark Bay in Australien und Europa großen Anklang fand.

Der Bergbau begann 1850 auf Egg Island vor der Ostküste von Dirk Hartog Island und breitete sich dann auf mindestens 13 Inseln im Henri Freycinet Harbour aus, die schnell abgetragen wurden. Dazu gehörten die Smith-, Sunday- und Eagle-Inseln sowie die North- und South-Guano-Inseln.

Um diese wertvolle Ware zu schützen, errichtete die Regierung 1850 eine Garnison in Quoin Bluff auf Dirk Hartog Island. Ein weiterer militärischer Außenposten wurde später am Kap Heirisson eingerichtet.

Guano war wertvoll, aber es stand viel auf dem Spiel. Schlechtes Wetter, unbekannte Untiefen und unsichere Ankerplätze machten es für große Schiffe schwierig. Im Jahr 1850 lief die 443 Tonnen schwere Bark Prince Charlie auf die Untiefe Levillain vor Kap Levillain auf, nachdem sie Guano geladen hatte. Diese Untiefe forderte 1878 auch die 125-Tonnen-Barke Macquarie mit Guano-Ladung. Die schiffbrüchigen Seeleute kämpften sich zurück zum Kap Levillain und liefen dann drei Tage lang ohne Nahrung und Wasser nach Süden, bis sie von einem Schiff in der Südpassage gerettet wurden.