Guanon louhinta oli Shark Bayn ensimmäinen maanpäällinen elinkeino, ja se käynnisti alueen eurooppalaisen asutuksen vuonna 1850. Se myös tarjosi Länsi-Australian siirtokunnalle yhden sen varhaisimmista kaupallisista vientituotteista.

Guano oli arvokasta ja kysyttyä ennen kemiallisten lannoitteiden kehittämistä. Guanon perulainen monopoli teki siitä kohtuuttoman kallista, joten sen löytyminen Shark Baysta sai hyvän vastaanoton Australiassa ja Euroopassa.

Valmistaminen alkoi vuonna 1850 Egg Islandilla Dirk Hartogin saaren itärannikolla, minkä jälkeen se eteni ainakin 13 saareen Henri Freycinetin satamassa ja riisui ne nopeasti. Näihin kuuluivat Smith-, Sunday- ja Eagle-saaret sekä North- ja South Guano -saaret.

Haluissaan suojella tätä arvokasta hyödykettä hallitus perusti varuskunnan Quoin Bluffiin Dirk Hartogin saarelle vuonna 1850. Toinen sotilaallinen etuvartio perustettiin myöhemmin Cape Heirissoniin.

Guano oli arvokas, mutta panokset olivat suuret. Huono sää, kartoittamattomat karikot ja epävarmat ankkuripaikat vaikeuttivat suurten alusten toimintaa. Vuonna 1850 443-tonninen proomu Prince Charlie törmäsi Levillainin matalikolle Cape Levillainin edustalla lastattuaan guanoa. Myös 125-tonninen proomu Macquarie, jonka lastina oli guanoa, joutui karille vuonna 1878. Haaksirikkoutuneet merimiehet kamppailivat takaisin Cape Levillainiin ja kävelivät sitten kolme päivää etelään ilman ruokaa tai vettä, kunnes alus pelasti heidät South Passagessa.