Pourquoi avons-nous besoin de tests de laboratoire pour les infections virales ?
Divers tests sont effectués dans un laboratoire pour établir ou confirmer le diagnostic d’une infection cutanée virale. Bien qu’une anamnèse et un examen approfondis du patient soient essentiels, les tests de laboratoire peuvent aider le clinicien à établir un diagnostic.
Qu’est-ce qu’un écouvillon cutané viral ?
Un écouvillon cutané viral est un instrument stérile frotté légèrement contre une lésion cutanée ou une vésicule visible. L’écouvillon est ensuite envoyé au laboratoire dans un milieu de transport viral pour une culture cellulaire virale supplémentaire et l’identification du virus.
Quels organismes les écouvillons viraux peuvent-ils détecter ?
Un écouvillon viral provenant d’une lésion cutanée externe ou d’une surface muqueuse peut détecter :
- Le virus de l’herpès simplex (HSV) de types 1 et 2 (cause des infections à herpès simplex, y compris l’herpès génital)
- Le virus varicelle-zona (VZV) (cause de la varicelle et du zona)
En outre, un écouvillon viral provenant de la muqueuse cutanée buccale peut détecter :
- Virus d’Epstein-Barr (EBV) (cause de la mononucléose infectieuse)
- Coxsackievirus A16 (une des causes de la maladie des mains, des pieds et de la bouche)
Ecouvillon cutané viral
Qu’est-ce qu’une culture cellulaire virale ?
La culture cellulaire virale place les échantillons dans des cultures cellulaires appropriées que le virus testé peut infecter. Lorsque les cellules présentent des changements particuliers, la culture est positive. La culture cellulaire virale peut identifier le HSV, le VZV, le morbillivirus (cause de la rougeole) et d’autres virus.
Quelles analyses sanguines sont nécessaires ?
Les tests sanguins pour l’investigation des infections virales comprennent :
- L’hémogramme complet – une infection virale peut augmenter ou réduire le nombre de globules blancs ; des lymphocytes atypiques peuvent être signalés
- Protéine C-réactive (CRP) – elle est élevée mais généralement inférieure à 50 dans une infection virale (la CRP est un marqueur d’inflammation n’importe où dans le corps et n’est pas un test spécifique pour les infections virales)
- Procalcitonine – elle est négative. C’est un test sanguin marqueur de la septicémie généralisée due à une infection bactérienne
- Sérologie – deux échantillons de sang testés à 10 jours d’intervalle pour déterminer la réponse immunitaire à un organisme particulier.
Réaction en chaîne par polymérase (PCR)
La PCR consiste à isoler et à amplifier des longueurs d’ADN, puis à détecter des séquences génétiques connues de micro-organismes. Les écouvillons cutanés peuvent être utilisés pour identifier :
- Le virus de l’herpès simplex (HSV)
- Le virus de la varicelle et du zona (VZV)
- Les coxsackievirus
- Le papillomavirus humain (HPV) (la cause des verrues virales et de certains types de cancer)
- Le virus de l’orf (un virus parapoxique des moutons/chèvres qui cause l’orf).
Le test immuno-enzymatique (ELISA)
L’ELISA permet de rechercher des organismes spécifiques soit en détectant l’antigène lors d’une infection en cours, soit plus couramment, l’anticorps antiviral. La détection de l’anticorps confirme le contact avec le virus à un moment donné mais n’est pas nécessairement la raison d’une infection actuelle.
Les anticorps viraux les plus fréquemment détectés sont dirigés contre :
- Le virus de la varicelle et du zona (VSV)
- Le virus de l’immunodéficience humaine (VIH)
- Le virus de l’hépatite B et C (dans le sérum), les principales causes d’hépatite virale.
Biopsie cutanée
Une biopsie cutanée peut être utile dans le diagnostic d’une infection virale. Un effet cytopathique viral peut être observé sur l’histopathologie ou le frottis de Tzanck, ou des traits spécifiques caractéristiques de l’infection particulière peuvent être présents.
Qu’est-ce que la microscopie électronique ?
La microscopie électronique consiste à diriger un faisceau d’électrons sur un échantillon produisant une image. Elle peut fournir des images de bien meilleure résolution qu’un microscope optique standard. Elle est rarement utilisée dans la pratique. Cependant, elle peut être utile pour identifier les infections virales atypiques et rares chez les patients immunodéprimés présentant des lésions cutanées inhabituelles.
Qu’est-ce que les tests de résistance aux virus ?
Les tests de résistance aux virus sont effectués pour aider le clinicien à savoir quels médicaments antiviraux peuvent ou non être efficaces contre l’infection. Comme les virus ont le potentiel de muter rapidement, beaucoup plus rapidement que les bactéries ou les champignons, cela représente un défi thérapeutique pour le clinicien, car le traitement avec des médicaments antiviraux peut commencer à échouer. La plus notable est la résistance aux antirétroviraux (ARV) du VIH, qui confère un grand risque au patient si les médicaments cessent de fonctionner.
L’analyse des séquences est réalisée le plus souvent au niveau génomique, qui examine directement le génome du VIH pour voir à quels antirétroviraux cette souche de VIH est déjà résistante et donc quels médicaments ne fonctionneront pas. Plus rarement, cette analyse est effectuée au niveau phénotypique, où le virus VIH du patient est soumis à des médicaments antirétroviraux en laboratoire pour voir comment il réagit.