Minamata, miasto, Kumamoto ken (prefektura), południowo-wschodnie Kyushu, Japonia. Jest położone w pobliżu południowego krańca zatoki Yatsushiro.
Miasto firmowe Nippon Chisso Hiryo Company, jego głównymi produktami są nawozy chemiczne, karbid i chlorek winylu. Minamata była tradycyjnie portem rybackim i ma regularne połączenia morskie z wyspą Amakusa, główną wyspą archipelagu Amakusa. W pobliżu znajdują się gorące źródła.
Po 1956 roku wśród miejscowych rybaków i ich rodzin rozpoznano czasami śmiertelną chorobę, którą nazwano „chorobą Minamata”. Przyczyna została określona jako organiczny związek rtęci w odpadach odprowadzanych przez lokalne fabryki chemiczne do morza. Związek ten koncentrował się w rybach i skorupiakach, które następnie były spożywane przez okolicznych mieszkańców. Ofiary choroby cierpią z powodu zatrucia rtęcią, co może skutkować opóźnieniem umysłowym, poważnymi wadami wrodzonymi, utratą wzroku i słuchu, paraliżem i śmiercią. Jako pierwsza choroba, której przyczyna została uznana za przemysłowe zanieczyszczenie wody morskiej, choroba Minamata wzbudziła niepokój na całym świecie i w znacznym stopniu przyczyniła się do rozwoju ruchu na rzecz ochrony środowiska. Zatoka Minamata została uznana za wolną od rtęci w lipcu 1997 roku. Sieci, które miały zapobiegać przedostawaniu się ryb do okolicznych wód zostały usunięte. Liczba ludności. (2005) 29,119; (2010) 26,978.