Co one oznaczają?
Pobierz pełną kartę informacyjną dotyczącą nieprawidłowych wyników cfDNA.
Co to jest badanie przesiewowe bezkomórkowego DNA (cfDNA)?
Badanie przesiewowe cfDNA (określane również jako nieinwazyjne badania prenatalne, NIPT, lub nieinwazyjne badania prenatalne, NIPS) jest badaniem przesiewowym, które wykorzystuje algorytmy bioinformatyczne i sekwencjonowanie następnej generacji fragmentów DNA w surowicy matki w celu określenia prawdopodobieństwa wystąpienia pewnych stanów chromosomowych w ciąży. Wszystkie osoby posiadają własne bezkomórkowe DNA w swoim strumieniu krwi. Podczas ciąży, bezkomórkowe DNA z łożyska (głównie komórki trofoblastu) również dostaje się do krwiobiegu matki i miesza się z bezkomórkowym DNA matki. DNA komórek trofoblastu zwykle odzwierciedla chromosomalny skład płodu.
cfDNA rutynowo przesiewa dla trisomii 21, trisomii 18 i trisomii 13. Dostępne są również badania przesiewowe w kierunku płci płodu, aneuploidii chromosomów płciowych, innych aneuploidii, triploidii i specyficznych warunków mikrodelecji. Warunki uwzględnione w panelu cfDNA różnią się w zależności od laboratorium wykonującego badanie. cfDNA nie może przesiewowo wykryć wszystkich chorób chromosomowych lub genetycznych.
Co oznacza nieprawidłowy wynik badania cfDNA?
Nieprawidłowy wynik wskazuje na zwiększone ryzyko wystąpienia określonego stanu. Nieprawidłowy wynik nie jest jednak diagnostyczny i pacjentom należy zaproponować wykonanie badań potwierdzających w ramach procedury diagnostycznej, takiej jak amniopunkcja. Nieprawidłowy wynik może wskazywać na dotknięty płód, ale może również reprezentować fałszywie dodatni wynik w ciąży nie dotkniętej chorobą, ograniczony mozaicyzm łożyskowy, mozaicyzm łożyskowy i płodowy, znikające bliźnięta, nierozpoznany stan matki lub inne nieznane zdarzenie biologiczne.
Jaka jest różnica między wynikiem „Pozytywny” lub „Wykryto aneuploidię” a wynikiem ryzyka „>99%”?
Różnica w raportowaniu jest specyficzna dla danego laboratorium, jednak wszystkie oznaczają to samo: istnieje zwiększone ryzyko. Wyniki te reprezentują ustalenia w cfDNA i mogą nie odzwierciedlać składu chromosomalnego płodu. Wynik >99% ryzyka nie oznacza, że istnieje większe niż 99% prawdopodobieństwo, że ciąża jest dotknięta daną chorobą. Wynik „Pozytywny” lub „Wykryta aneuploidia” nie oznacza, że płód definitywnie ma chorobę chromosomową.
Jak dokładny jest nieprawidłowy wynik?
Testy te są często reklamowane pacjentom i pracownikom służby zdrowia jako >99% dokładne. Ważne jest, aby zdawać sobie sprawę, że jest to statystyka na poziomie populacji i odnosi się do wszystkich badanych kobiet. Ponieważ większość ciąż jest nienaruszona i większość wyników jest „niskiego ryzyka”, test ten jest poprawny w 99% przypadków dla wszystkich kobiet. Jednakże szansa, że wynik wysokiego ryzyka wskazuje na dotknięty płód nie wynosi 99% w większości przypadków. Aby określić szansę na to, że wynik wysokiego ryzyka będzie prawdziwie pozytywny, należy obliczyć pozytywną wartość predykcyjną.
Co to jest pozytywna wartość predykcyjna?
Pozytywna wartość predykcyjna (PPV) to odsetek wyników pozytywnych, które są prawdziwie pozytywne. Innymi słowy, PPV odpowiada na pytanie: „Jaka jest szansa, że nieprawidłowy wynik cfDNA oznacza, że płód ma tę chorobę?”. PPV zależy nie tylko od czułości i swoistości testu, ale w dużym stopniu zależy od częstości występowania danego schorzenia. Poniżej podsumowano dane z pięciu różnych badań oceniających PPV badań przesiewowych z użyciem cfDNA.
Jak wykazały te badania, PPV różni się w zależności od stanu chorobowego, badanej populacji i częstości występowania stanu chorobowego w tej populacji (ryzyko a priori), a także czułości i swoistości badania przesiewowego cfDNA. Chociaż badania potwierdzają, że badanie przesiewowe cfDNA ma wyższą wartość PPV niż tradycyjne testy przesiewowe, należy zauważyć, że te wartości PPV nie mogą być uniwersalnie stosowane u pacjentów. Wartość PPV będzie wyższa w przypadku pacjentów, u których prawdopodobieństwo a priori jest wyższe na podstawie wieku lub innych wyników badań przesiewowych; wartość PPV będzie niższa u kobiet z niższym ryzykiem a priori. Na przykład, przy wszystkich innych czynnikach równych, PPV jest wyższe dla kobiet w wieku 40 lat niż w wieku 20 lat, ponieważ ryzyko a priori aneuploidii wzrasta wraz z wiekiem matki.
Jak mam wyjaśnić te wyniki mojemu pacjentowi?
Można wyjaśnić te wyniki podobnie jak w przypadku innych testów przesiewowych, biorąc pod uwagę, że badania przesiewowe cfDNA mają mniej wyników fałszywie dodatnich niż tradycyjne badania przesiewowe. Podczas gdy wynik nieprawidłowy znacznie zwiększa niepokój, nie daje on odpowiedzi diagnostycznej i konieczne jest przeprowadzenie dalszych badań w celu potwierdzenia. Stopień zaniepokojenia w dużym stopniu zależy od czułości i swoistości badania przesiewowego oraz częstości występowania zaburzeń, na którą mogą mieć wpływ określone schorzenie, wiek matki, wiek ciążowy, wyniki badania ultrasonograficznego i wywiad rodzinny.
Na przykład 44-latek, u którego stwierdzono zwiększoną przezierność karkową płodu i nieprawidłowy wynik badania cfDNA w kierunku zespołu Downa, ma bardzo duże szanse na uzyskanie wyniku prawdziwie dodatniego (ponieważ częstość występowania, a więc i PPV, jest w tej populacji wysoka). Porównaj to z 24-latkiem z prawidłowym wynikiem badania ultrasonograficznego i nieprawidłowym wynikiem cfDNA dla trisomii 13, który ma mniejsze szanse na uzyskanie wyniku prawdziwie pozytywnego (ponieważ częstość występowania, a zatem PPV, jest niska w tej populacji). Podobnie jak w przypadku tradycyjnych badań przesiewowych surowicy matki, nie wszystkie nieprawidłowe wyniki wskazują na ten sam stopień ryzyka.
Co się stanie, jeśli wystąpią również nieprawidłowe wyniki badań ultrasonograficznych?
Ale nieprawidłowe wyniki badań ultrasonograficznych mogą zwiększyć podejrzenie konkretnego schorzenia, badanie ultrasonograficzne nie jest diagnostyczne i powinno być stosowane jako kolejne narzędzie do oceny ryzyka. Badania inwazyjne są konieczne, aby ostatecznie potwierdzić rozpoznanie i pomóc w poradnictwie genetycznym w celu oceny ryzyka nawrotu, rokowania i postępowania.
Jakie są dalsze kroki?
Wszystkim kobietom z nieprawidłowym wynikiem badania cfDNA należy zaproponować badanie potwierdzające za pomocą CVS lub amniopunkcji. Pacjentki decydujące się na wykonanie CVS w celu potwierdzenia powinny zostać poinformowane o ograniczeniach tej techniki, ponieważ ograniczony mozaicyzm łożyskowy może tłumaczyć nieprawidłowy wynik cfDNA i może zostać wykryty podczas CVS, zwłaszcza gdy zlecono FISH w kierunku aneuploidii. Komórki trofoblastu są głównym źródłem wolnego od komórek DNA we krwi matki i są również komórkami analizowanymi w teście aneuploidii FISH. Ograniczony mozaicyzm łożyskowy może być przyczyną nieprawidłowego wyniku cfDNA oraz nieprawidłowego wyniku CVS FISH i/lub kariotypu. Komórki analizowane przez amniopunkcję nie są zazwyczaj dotknięte ograniczonym mozaicyzmem łożyskowym, ponieważ pochodzą one głównie ze skóry płodu i układu moczowo-płciowego.
Co jeśli moja pacjentka odmówi wykonania badań inwazyjnych?
Jeśli badania diagnostyczne zostaną odrzucone, postępowanie z ciężarną powinno być podyktowane wynikami badania ultrasonograficznego i wskazaniami matki. Dodatkowe badania ultrasonograficzne i echokardiograficzne płodu mogą być rozważone, gdy wyniki cfDNA są nieprawidłowe. Po porodzie wskazana jest ocena postnatalna za pomocą badania fizykalnego i (lub) kariotypu.
Jak mogę znaleźć doradcę genetycznego?
Doradcy genetyczni są pracownikami służby zdrowia ze specjalistycznym przeszkoleniem w zakresie badań przesiewowych cfDNA oraz psychospołecznych zawiłości związanych z badaniami genetycznymi i badaniami przesiewowymi. Mogą oni pomóc w wyjaśnieniu pacjentowi wyników badań, pomóc pacjentowi zrozumieć chorobę genetyczną i ułatwić podjęcie decyzji o dalszych badaniach. Doradcę genetycznego można znaleźć, korzystając z linku „Find a Genetic Counselor” (Znajdź doradcę genetycznego) na stronie internetowej nsgc.org. Więcej informacji na temat poszczególnych schorzeń genetycznych i krajowych organizacji działających na rzecz tych schorzeń można również znaleźć na stronie www.lettercase.org/prenataltesting/ .
- Wang JC, Sahoo T, Schonberg S, Kopita KA, Ross L, Patek K, Strom CM. Discordant noninvasive prenatal testing and cytogenetic results: a study of 109 consecutive cases. Genet Med. 2014 Aug 7.
- Bianchi DW, Parker RL, Wentworth J, Madankumar R, Saffer C, Das AF, Craig JA, Chudova DI, Devers PL, Jones KW, Oliver K, Rava RP, Sehnert AJ; CARE Study Group. DNA sequencing versus standard prenatal aneuploidy screening. N Engl J Med. 2014 Feb 27; 370(9):799-808.
- Choy KW, Kwok KY, Lau ET, et al. Discordant kariotype results among noninvasive prenatal screening positive cases. In: The Shifting Landscape of Genetic Testing: Approaches and Success Stories, Platform Session, Abstract #19, American Society of Human Genetics 2013 Annual Meeting, Boston, MA, USA, 2013.
- Meck JM, Dugan EK, Aviram A, et al. Non-invasive prenatal screening: a cytogenetic perspective. In: Oral Platform Presentations: Cytogenetics, Abstract #17, American College of Medical Genetics and Genomics 2014 Annual Meeting, Nashville, Tennessee, USA, 2014.
- Norton ME, Jacobsson B, Swamy GK, et al. Cell-free DNA analysis for noninvasive examination of trisomy. N Engl J Med. 2015 Apr 23; 372(17):1589-97.
Fact Sheet for Medical Professionals. Produkt National Society of Genetic Counselors (NSGC) Prenatal Special Interest Group, czerwiec 2015. Zatwierdzone przez American College of Obstetricians and Gynecologists (ACOG), 10 czerwca 2015 r., i powinny być interpretowane jako wytyczne kliniczne ACOG.