Na wieść o mongolskiej misji w Rosji rząd Qing polecił Sando przeprowadzenie dochodzenia. Sando natychmiast wezwał szefa administracji kościelnej Khutukhtu (Ikh shav’), Erdene Shanzav, i zażądał wyjaśnień. Erdene Shanzav, tłumacząc się, że nie był w to zamieszany, ujawnił cały spisek. Sando zażądał wtedy od Khutuktu wycofania prośby o rosyjskie wojska. Khutuktu zgodził się, pod warunkiem, że Sando zlikwiduje Nową Administrację. Sando wysłał do Pekinu depeszę z prośbą o instrukcje i otrzymał odpowiedź, że część Nowej Administracji może być opóźniona.
Sando nakazał książętom w Urdze podpisanie oświadczenia, że tylko kilka osób było odpowiedzialnych za apel do Rosji. Książęta złożyli takie oświadczenie, ale tylko ustnie. Następnie Sando nakazał Mongołom, aby nie kontaktowali się więcej z konsulatem rosyjskim, grożąc, że w razie nieposłuszeństwa sprowadzi do Urgi dodatkowe 500 żołnierzy i uzbroi ludność chińską w mieście. Wokół pałacu Khutuktu postawił posterunki z rozkazem nie wpuszczania rosyjskich gości. Wysłał też kontyngent wojska na granicę rosyjsko-mongolską, aby przechwycić mongolską delegację do Rosji w drodze powrotnej.
Wydarzenia o rozmiarach sejsmicznych miały wtedy miejsce w samych Chinach. Na 10 października było powstanie w Wuchang i rewolucja przeciwko mniejszości klasy rządzącej rozpoczął. Jeden prowincja po inny ogłaszać swój niezależność od the Qing władza. Uważając, że jego pozycja jest nie do utrzymania, Sando wysłał do rządu pekińskiego list z prośbą o pozwolenie na rezygnację, ale jego prośba została odrzucona. W międzyczasie mongolska delegacja do Rosji potajemnie wróciła, a wyniki swojej podróży zrelacjonowała grupie książąt i lamów. Złożyli oni wspólny memoriał do Khutukhtu z pytaniem, co Mongolia powinna zrobić w miejsce powstań prowincjonalnych. Doradził, aby Mongołowie utworzyli własne państwo.
Zachęcony poparciem Khutuktu i zbliżającym się upadkiem dynastii Qing, powstał Tymczasowy Rząd Chalkha, na czele którego stanęło kilku wybitnych szlachciców z Chalkha. 28 listopada rząd nakazał wszystkim czterem prowincjom (aimag) Chalki zmobilizować po tysiąc żołnierzy. Niemal natychmiast w Urdze zebrało się 500 mężczyzn z sąsiednich khoshuunów. Dwa dni później Sando otrzymał list, podpisany w imieniu arystokratów i lamów z Chalkhy, w którym informowano, że słyszano o ruchu secesjonistycznym w Chinach i że chińskie oddziały „partii rewolucyjnej” przygotowują się do marszu na Urgę z Mongolii Wewnętrznej. W dalszej części listu stwierdzono, że w związku z korzyściami uzyskanymi przez Chalkhów od Qingów w przeszłości, Khutuktu zarządził mobilizację 4000 żołnierzy, którzy mieli ruszyć na Pekin w obronie cesarza. Sando został poproszony o dostarczenie tym ludziom prowiantu i broni. Dano mu trzy godziny na odpowiedź. Żadna odpowiedź nie nadeszła. Porzucając to cienkie oszustwo, delegacja szlachty i lamów odwiedziła biuro ambana i poinformowała go o swojej decyzji ogłoszenia niepodległości i zainstalowania Khutuktu jako cesarza. Sando błagał delegację. Przyznał, że to, co się wydarzyło, było wynikiem jego własnej głupoty i obiecał, że będzie rekomendował pełną autonomię dla Mongolii, ale nie niepodległość. Delegacja kurtuazyjnie odpowiedziała, że przybyła tylko po to, by przekazać wiadomość, a nie po to, by o niej dyskutować. Sando otrzymał rozkaz opuszczenia kraju w ciągu 24 godzin.
Sando niewiele mógł zrobić. Miał tylko 150 żołnierzy, którzy i tak byli w opornym nastroju z powodu zaległości w zaległym żołdzie. Następnego dnia jego żołnierze zostali rozbrojeni przez mongolskich milicjantów, a także rosyjskich Kozaków z konwoju konsularnego pod dowództwem Grigorija Siemionowa, przyszłego atamana. Sando i jego sztab dla własnego bezpieczeństwa przenieśli się do kompleksu konsulatu rosyjskiego.
30 listopada 1911 Mongołowie ustanowili Tymczasowy Rząd Chalkha. 5 grudnia Sando opuścił Mongolię z rosyjską eskortą. Władza chińska w pozostałej części kraju szybko się załamała. Jeszcze w tym samym miesiącu lub w styczniu 1912 r. (źródła różnią się) gubernator wojskowy Uliastai w zachodniej Mongolii, jego personel i gwardia wojskowa, spokojnie wyjechali pod ochroną wojsk kozackich. Zastępca gubernatora wojskowego w Khovd postanowił jednak stawić opór, licząc na posiłki z Xinjiangu. Wojska przybyły za późno: miasto zostało otoczone przez oddziały mongolskie, oddziały posiłkowe zostały rozbite. W sierpniu 1912 roku, jego twierdza została pokonana przez wojska mongolskie, a on i jego personel został odprowadzony z kraju przez Kozaków.
1 grudnia, Tymczasowy Rząd Chalkha wydał ogólną proklamację ogłaszając koniec rządów Qing i ustanowienie teokracji pod Jebtsundamba Khutuktu. Pod koniec miesiąca, 29 grudnia, Khutuktu został formalnie mianowany Bodg Khaanem („Wielkim Chanem” lub „Cesarzem”) nowego państwa mongolskiego. Tym samym rozpoczęła się era Bogd Chana. Podczas gdy wszystkie Barga, Dariganga, Khovd, Huvsgul region, 26 hoshunów z regionu Ili (Dzungarian Oirads), 24 hoshunów z Górnej Mongolii 29 hoshunów, 35 hoshunów z Wewnętrznej Mongolii 49 hoshunów wysłało oświadczenia, aby poprzeć wezwanie Bogd Khana do zjednoczenia Mongolii, w rzeczywistości jednak większość z nich była zbyt ostrożna lub niezdecydowana, aby spróbować dołączyć do reżimu Bogd Khana.
Rewolucja mongolska była w przeważającej części uporządkowanym przekazaniem władzy. Jej stosunkowo pokojowy charakter wynikał z realizmu władz Qing w Mongolii, a w niemałej mierze z obecności wojsk rosyjskich, które zapewniały ochronę tym władzom i wojskom chińskim. Inaczej sytuacja wyglądała w Mongolii Wewnętrznej. Tam władze chińskie pozostały u władzy, mimo że działacze mongolscy przygotowywali się do przyłączenia się do Mongolii Zewnętrznej w walce o niepodległość. Członkowie pro-Qing Royalist Party byli znani z poparcia dla niepodległości Mongolii Wewnętrznej, a niektórzy opowiadali się za monarchistycznym państwem obejmującym Mandżurię oraz Mongolię Zewnętrzną i Wewnętrzną. Gungsangnorbu, przywódca Wewnętrznej Mongolskiej Chorągwi Harqin, nawiązał bliskie kontakty z Japończykami w grudniu 1911 roku. On i inni książęta Mongolii Wewnętrznej wzięli pożyczki, obiecali Japończykom prawa górnicze i otrzymali duże dostawy broni.