Exploatarea guano a fost prima industrie terestră din Shark Bay și a inițiat colonizarea europeană a zonei în 1850. De asemenea, a furnizat coloniei din Australia de Vest unul dintre primele sale exporturi comerciale.

Guano era valoros și solicitat înainte de dezvoltarea îngrășămintelor chimice. Un monopol peruvian asupra guano îl făcea prohibitiv de scump, astfel încât descoperirea sa în Shark Bay a fost bine primită în Australia și Europa.

Exploatarea minieră a început în 1850 la Egg Island, în largul coastei de est a Insulei Dirk Hartog, apoi a progresat și a dezbrăcat rapid cel puțin 13 insule din portul Henri Freycinet. Printre acestea se numărau insulele Smith, Sunday și Eagle, precum și insulele North și South Guano.

Nerăbdător să protejeze această marfă valoroasă, guvernul a înființat o garnizoană la Quoin Bluff pe insula Dirk Hartog în 1850. Un alt avanpost militar a fost stabilit ulterior la Cape Heirisson.

Guano era valoros, dar miza era mare. Vremea rea, bancurile necartografiate și ancorele nesigure au îngreunat situația pentru navele mari. În 1850, barcul Prince Charlie, de 443 de tone, s-a lovit de bancul Levillain, în largul Capului Levillain, după ce a încărcat guano. De asemenea, în 1878, pe acest banc de nisip s-a prăbușit și corabia Macquarie, de 125 de tone, cu o încărcătură de guano. Marinarii naufragiați s-au zbătut cu greu până la Capul Levillain, apoi au mers spre sud timp de trei zile, fără mâncare sau apă, până când au fost salvați de o navă în Pasajul Sudului.

.