Guanogruvdrift var den första landbaserade industrin i Shark Bay och inledde den europeiska bosättningen i området 1850. Den försåg också kolonin Västaustralien med en av dess tidigaste kommersiella exportvaror.

Guano var värdefullt och efterfrågat innan utvecklingen av kemiska gödselmedel. Ett peruanskt monopol på guano gjorde det oöverkomligt dyrt, så upptäckten i Shark Bay mottogs väl i Australien och Europa.

Mineringen startade 1850 på Egg Island utanför Dirk Hartog Islands östkust och fortsatte sedan till minst 13 öar i Henri Freycinet Harbour, som snabbt avskalades. Bland dessa fanns Smith-, Sunday- och Eagle-öarna samt norra och södra Guano-öarna.

I sin strävan att skydda denna värdefulla råvara upprättade regeringen 1850 en garnison vid Quoin Bluff på Dirk Hartog Island. En annan militär utpost upprättades senare vid Cape Heirisson.

Guano var värdefull men insatserna var höga. Dåligt väder, okända kobbar och osäkra ankarplatser gjorde det svårt för stora fartyg. År 1850 stötte den 443 ton tunga barken Prince Charlie på Levillain-sundet utanför Cape Levillain efter att ha lastat guano. Detta grund tog även den 125 ton tunga barken Macquarie med guanolast i anspråk 1878. De skeppsbrutna sjömännen kämpade sig tillbaka till Cape Levillain och vandrade sedan söderut i tre dagar utan mat och vatten tills de räddades av ett fartyg i South Passage.