La microscopia elettronica è ampiamente utilizzata in virologia perché i virus sono generalmente troppo piccoli per un’ispezione diretta con la microscopia ottica. L’analisi della morfologia dei virus è necessaria in molte circostanze, ad esempio per la diagnosi di un virus in particolari situazioni cliniche o per l’analisi dell’ingresso e dell’assemblaggio dei virus. Inoltre, il controllo di qualità dell’integrità delle particelle virali è necessario se un virus viene propagato in coltura cellulare, in particolare se il genoma del virus è cambiato.

Nella maggior parte dei casi già la metodologia di base della microscopia elettronica a trasmissione, cioè la colorazione negativa e la sezione ultrasottile, è sufficiente per dare informazioni rilevanti sull’ultrastruttura del virus. Questo capitolo fornisce informazioni dettagliate sui principi di queste metodologie di base e fornisce protocolli semplici ma affidabili per un rapido inizio. Inoltre, la descrizione dei protocolli standard per la colorazione negativa e il sezionamento ultrasottile sono integrati da protocolli sulla colorazione immuno-negativa e sul sezionamento ultrasottile rapido. Infine, i principi dei metodi per una ricerca ultrastrutturale estesa utilizzando tecniche più elaborate, come le criotecniche o i metodi per rivelare l’architettura tridimensionale del virus, sono brevemente rivisti.