輪作とは、ある圃場で作物の後継者を組織化することである。 輪作は一定周期で行われ、その周期は長くても短くてもよい。 2種類の作物を1年ごとに連続して栽培する場合は2年生、3種類の作物を栽培する場合は3年生などと呼ばれる。 アグロエコロジーの観点からは、輪作は栽培する植物が多様でなければならないと考えられている。

輪作が多様であれば、害虫や病原菌は宿主種を見つけることが難しくなる（1）。 また、作物の生育期間が不均質であるため、雑草の発生サイクルを崩すことができる。 最後に、単一栽培に比べ、輪作多品種は土壌の貧弱化を抑制することができる。 輪作にマメ科植物が含まれることで、土壌に窒素が供給される(2)。 さまざまな種類の作物残渣は、土壌の構造と生命を向上させ、植物に必要な栄養素のストック回復を促進する。 また、異なる作物の根系が補完しあうことで、土壌の構造にも良い影響を与えます(3)。 したがって輪作は、生物学的（1）、化学的（2）、物理的（3）の3種類の利益を土壌にもたらす。

化学物質の投入を減らすために、キャッチクロップ、マメ科植物の設置、下作などを通じ、長期的で多様な輪作の実施が奨励されている。 輪作の期間と選択される作物種は、その状況によって大きく異なります。 そのため、輪作を行うには、技術的な知識と高い専門性が求められます。 輪作の効果は長期的（5～10年）には確認できるが、これも状況（経済、地理、気候…）による。