Kukin yksittäinen yksikkö taitetaan neliönmuotoisesta paperiarkista, jonka vain toinen puoli näkyy valmiissa moduulissa; tavallisesta Sonobe-yksiköstä on suunniteltu monia koristeltuja muunnelmia, jotka paljastavat paperin molemmat puolet.
Sonobe-yksikkö on muodoltaan rinnakkaisruutu, jonka kulmat ovat 45- ja 135-asteiset ja joka on jaettu taitoksilla kahteen diagonaaliseen välilehteen päädyissä ja kahteen vastaavaan taskuun kaiverretussa keskimmäisessä neliön keskikuvioidussa ruudussa. Järjestelmä voi rakentaa monenlaisia kolmiulotteisia geometrisia muotoja telakoimalla nämä välilehdet viereisten yksiköiden taskuihin. Kolme toisiinsa liitettyä Sonobe-yksikköä muodostaa avopohjaisen kolmiomaisen pyramidin, jonka avopohja on tasasivuinen kolmio ja kolme muuta sivua ovat tasakylkisiä suorakulmaisia kolmioita. Sillä on suorakulmainen kärki (joka vastaa kuution kulmaa) ja kolme pohjasta ulkonevaa välilehteä/taskun läppää. Tämä sopii erityisesti polyedereille, joilla on tasasivuiset kolmionmuotoiset sivut: Sonobe-moduulit voivat korvata alkuperäisen deltaedrin jokaisen kuvitteellisen reunan yhden yksikön keskimmäisellä diagonaalisella taitteella ja jokaisen tasasivuisen kolmion suorakulmaisella pyramidilla, joka koostuu yhdestä puolikkaasta kutakin kolmea yksikköä, ilman roikkuvia läppiä. Pyramidit voidaan saada osoittamaan sisäänpäin; kokoaminen on vaikeampaa, mutta jotkin kuroutumistapaukset voidaan ilmeisesti estää.
Yksinkertaisin näistä pyramideista tehty muoto, jota kutsutaan usein ”Toshien jalokiveksi” (kuvassa oikealla), on nimetty origamin harrastajan Toshie Takahaman mukaan. Se on kolmiosainen heksaedri, joka on rakennettu tasasivuisen tasakylkisen kolmion kuvitteellisen telineen ympärille (kaksi ”sivua”, kolme reunaa); ulkonevat välilehdet/taskuläpät yhdistetään yksinkertaisesti uudelleen alapuolelta, jolloin saadaan kaksi kolmionmuotoista pyramidia, jotka on yhdistetty tyvestä, kolmionmuotoinen kaksoispyramidi.
Suosituin välimuoto on triakisikosaedri, joka on kuvassa alla. Sen rakentamiseen tarvitaan 30 yksikköä.