La conoscenza dell’origine e della storia della domesticazione delle piante coltivate è importante per gli studi che mirano ad evitare l’erosione delle risorse genetiche dovuta alla perdita di ecotipi e di landraces e di habitat e alla maggiore urbanizzazione. Tale conoscenza rafforza anche la capacità del sistema agricolo moderno di sviluppare e scalare l’addomesticamento di colture di alto valore potenziale che può essere raggiunto migliorando le conoscenze che aiutano a identificare e selezionare specie di piante di alto valore all’interno della loro località, identificare e applicare le tecniche di propagazione più appropriate per migliorare le colture e integrare le specie di colture migliorate nei sistemi agricoli. Lo studio della storia dell’addomesticamento e dell’ascendenza fornisce i mezzi per la conservazione del germoplasma attraverso la creazione di banche genetiche, in gran parte come collezioni di semi, e la conservazione degli habitat naturali. Le informazioni sull’evoluzione delle colture e in particolare sui modelli di cambiamento genetico generati dall’evoluzione prima, durante e dopo la domesticazione, sono importanti per sviluppare validi programmi di conservazione genetica delle risorse genetiche delle piante coltivate e aumentano anche l’efficienza dei programmi di selezione. Negli ultimi anni, gli approcci molecolari hanno contribuito alla nostra comprensione degli aspetti dell’evoluzione delle piante e della domesticazione delle colture. In questo articolo, gli aspetti della domesticazione delle colture sono delineati e il ruolo dei dati molecolari nel chiarire l’origine e la domesticazione delle piante coltivate. Particolare enfasi è data al contributo degli approcci molecolari all’origine e alla storia della domesticazione dell’orzo e all’origine e all’ascendenza del trifoglio egiziano.