O conhecimento da história da origem e domesticação das plantas cultivadas é importante para estudos destinados a evitar a erosão dos recursos genéticos devido à perda de ecótipos e de habitats e ao aumento da urbanização. Tal conhecimento também reforça a capacidade do sistema agrícola moderno de desenvolver e ampliar a domesticação de culturas de alto valor potencial que pode ser alcançada através da melhoria do conhecimento que ajuda a identificar e selecionar espécies de plantas de alto valor dentro da sua localidade, identificar e aplicar as técnicas de propagação mais adequadas para melhorar as culturas e integrar espécies melhoradas nos sistemas agrícolas. O estudo da história da domesticação e da ancestralidade fornece meios para a preservação do germoplasma através do estabelecimento de bancos de genes, em grande parte como coleções de sementes, e a preservação de habitats naturais. A informação sobre a evolução das culturas e especificamente sobre os padrões de mudança genética gerados pela evolução antes, durante e após a domesticação é importante para desenvolver programas sólidos de conservação genética dos recursos genéticos das plantas cultivadas e também aumenta a eficiência dos programas de reprodução. Nos últimos anos, as abordagens moleculares têm contribuído para a nossa compreensão dos aspectos da evolução das plantas e domesticação das culturas. Neste artigo, os aspectos da domesticação de cultivos são delineados e o papel dos dados moleculares na elucidação da ancestralidade e domesticação das plantas cultivadas são delineados. É dada especial ênfase à contribuição das abordagens moleculares para a origem e história da domesticação da cevada e a origem e ancestralidade do trevo egípcio.